1、   内科治疗：由于肝脏进行性萎缩和进行性临床症状，单纯使用内科治疗的预后谨慎至很差。内科治疗的预后决定指标是临床症状出现时的年龄（年龄越大则存活时间越长）和BUN浓度（浓度越高存活时间越长）。胆汁酸浓度、血清蛋白浓度、白蛋白、ALP、ALT、MCV和存活时间无相关性。

2、   EHPSS：结扎死亡率介于2%~32%间，缩窄环放置死亡率7%，玻璃纸绷扎死亡率6%~9%。最近研究显示，年龄与长期预后关系不大，因为较老的犬（>4岁）在外科手术时表现与年轻动物一样好。门体分流减弱最常见死亡原因是严重的持续性神经症状。其它病因包括手术期出血、术后凝血紊乱、门脉高压和出血性胃肠炎。使用缩窄环放置的患犬，术前低白蛋白血症经常伴有术后持续性分流。术前低白蛋白血症或白细胞增多症、术后发生癫痫以及术后6~10周持续性分流长期预后不良。

3、   IHPSS：平均存活时间据报道为1至3年。体重（>10kg）、总蛋白（>4g/dL）、血清白蛋白（>2.6g/dL）和BUN（>7.4g/dL）水平是短期预后和并发症易发性的预测指标，尽管PCV和总蛋白（>4g/dL）被看做长期存活的预测指标。术前低白蛋白血症或白细胞增多症、术后发生癫痫以及术后6~10周持续性分流也是长期预后较差的预测指标。术后并发症据报道高达77%，短期死亡率为11%~28%。总体死亡率为23%~63.6%。IHPSS患犬，术后血清胆汁酸浓度降至正常并不伴有短期或长期存活。门体分流部分或全部结扎后患犬临床症状改善，但血清胆汁酸保持升高，据此判断其并非预测预后的指标。PTCE程序手术期死亡率已下降至<5%，长期死亡率<30%（使用长期抗酸治疗死亡率<15%）。长期发病率和死亡率最常见原因是严重胃肠道溃疡和出血。自从引入终身抗酸治疗后，胃肠道溃疡所致死亡率由25%下降至3.2%。有趣的是，IHPSS不同的研究在预后方面无差异。

4、   HAVM：HAVM患犬经历胶栓塞治疗的存活率为100%，伴有或不伴有肝切除，75%~91%患犬仅通过手术治疗。单纯使用外科治疗的患犬38%~57%长期预后良好或好，使用胶栓塞治疗的患犬接近70%长期预后良好或好。由于动脉丛开放，一系列栓塞程序可能是必要的。不论治疗方法为何，约75%患犬需要继续使用日粮或内科治疗控制临床症状。如果门脉系统发育良好，这些患病动物使用腔绷扎法治疗还是有用的。

5、   MVD/PVH：22/24（92%）长期预后较好，或者死于与MVD无关的原因。

6、   NVPH：13/33（40%）长期存活，但由于未进行内科治疗而在外科手术的发现使得许多患病动物被安乐死。总体上预后良好。

7、   猫门体分流：结扎后手术期间死亡率介于0%~23%间。高达75%的猫据报道存在术后并发症。最常见的是神经功能紊乱，包括全身性癫痫、中枢性失明（术后数月后能恢复）。存活的患猫追访，通过各种结扎技术治疗66%~80%的患猫长期预后好或极好。约25%存在持续分流的患猫预后极好，闪烁现象或肝功能检测正常的患猫57%存在持续或复发性神经功能异常。术后持续性分流在猫也常见，据认为是由于出现多个EHPSS所致。不管患猫较高的并发症，与犬相比，总体死亡率较低。

8、   获得性门体分流：患有慢性门脉高压的动物可出现多个获得性EHPSS，这可能继发于HAVM、NCPH或慢性肝炎/肝硬化。获得性分流患犬经常出现肝脑病症状和腹水。由于这些分流是为了缓解门脉高压，对分流血管进行结扎不是合适的或有效的。腔绷扎法引导血流进入门静脉也有相关尝试。并发症包括腹水、后肢水肿、其它门奇静脉分流和持续性较差的门脉灌注。这些病例的存活时间与使用内科治疗相比，二者相似。犬猫单个先天性EHPSS使用缩窄环治疗10%~20%的病例可出现多个EHPSS。治疗目的应该着重于控制肝脑病临床症状，延缓肝脏疾病进程（通常是肝纤维化）。