甲状腺机能亢进猫的预后与下述因素有关：诊断时的体况；是否存在并发症和并发症的严重程度，特别是肾功能不全；肿物的组织学特性（例如，增生、腺瘤或腺癌）；根据猫临床体况、功能性甲状腺肿物的数量和肿物的位置选择的合理治疗方法；治疗副作用的避免。适当情况下使用，任何一种治疗方法都可能成功。手术和¹³¹I都有治愈的可能，但三种治疗方法都可以控制临床症状。如果能避免甲巯咪唑的副反应，它可控制甲状腺增生或腺瘤引起的甲状腺机能亢进数年。甲状腺切除和¹³¹I治疗后数月至数年可复发甲状腺机能亢进（但并不是所有猫均复发）。一流行病学调查表明，231只甲状腺机能亢进猫用¹³¹I治疗的存活时间平均为25个月（范围：3天至8年）。肾相关疾病和肿瘤是死亡时最常见的问题。