离子透镜用于聚焦来自离子源的离子，在四极杆上只加RF射频电压；大孔径设计使更多离子能进入质量分析器；用气动学原理和RF射频电压将离子捕获，并聚焦进入质量分析器的高真空区域。这是提高灵敏度的基础。

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实物图

三、创新的弯曲的LINAC碰撞室，提高了离子传输速度，增加了离子容量，改善了质谱数据质量

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核心结构图 

    Q2是弯曲的LINAC碰撞室，它提高了LINAC轴向电场，所以具有更快的离子传输能力。优势在于：（1）减小仪器体积，减轻分子泵的压力（只需一个分子泵）；（2）弯曲碰撞室设计可极大地降低中性物质的进入；（3）硬件的改进以及新的线性加速器的设计，再结合软件和电子学的完善，在进行MRM实验时，具有更短的停顿时间和驻留时间，同时不降低质谱数据质量（比如时间即使为几个毫秒，灵敏度不下降）。比如通常，Q2的电压为50V，相比以前仪器的1.9V，可以使离子获得更快的加速。

四、提供了线性加速的离子阱Linear Accelerated™ Trap：更快的扫描速度，更快的分析时间
 

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线性加速的离子阱

    提高线性离子阱灵敏度的原因来自于：
（1）线性加速离子阱技术，是在线性离子阱内增加一轴向电压，目标离子在扫描前更向萃取区域集中（离子被浓缩）。
（2）改善散射场：在离子萃取区适当增加一定相辅助射频电压

    谱图质量更高、离子阱内的质谱碎片更丰富的原因来自于：
（1）脉冲气的引入能更快地冷却离子
（2）脉冲气和更高的RF电压，能在很短的离子激活时间内在离子阱内产生更丰富的离子碎片信息

    以前的Qtrap3200和Qtrap 4000，离子阱的扫描速度为4,000 amu/sec，Qtrap 5500提高到20,000 amu/sec。

    更短的离子阱碎片扫描时间，以前是几个毫秒，现在可到50微秒

优点：

• 更高离子容量的线性离子阱
• 灵敏度提高（阱的扫描灵敏度提高了100倍）
• 扫描速度提高5倍（20,000 amu/sec）
• 离子填充时间缩短20倍
• 分辨率提高2倍（优于12,000）
• 质荷比精度提高3倍