细菌基因组DNA的提取(CTAB/NaCl 法)
(2009-04-10 15:45:24)
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bio杂谈 |
分类: 实验方法 |
1、接种一单菌落于5mlLB中,30℃培养过夜。
2、取1ml种子培养液接入100ml 2%LB中,37℃、220r/min培养16小时;
3、5000r/min离心10分钟,弃去上清。
4、加入10mlTE离心洗涤后,用10mlTE溶解菌体,混匀,-20℃保存备用。
5、取3.5ml菌悬液,加入184μl 10%SDS,混匀,加入37μl10mg/ml蛋白酶K,混匀,37℃温育1小时
6、加入740μl 5mol/LNaCl,再加入512μl CTAB/NaCl (质量浓度50 g/ L CTAB ,0.5 mol/ L NaCl), 混匀,65℃温育10分钟。
7、加入等体积的氯仿/异戊醇(24:1),混匀,10000r/min离心5分钟,保留上清。
8、上清中加入等体积的酚∶氯仿∶异戊醇(25∶24∶1),混匀,10000r/min离心5分钟,保留上清。
9、加入0.6倍的异丙醇,混匀,10000r/min离心5分钟,收集DNA沉淀,用70%乙醇离心洗涤DNA沉淀。
10、用1mlTE溶解DNA,加入终浓度为20μg/mlRNaseA,4℃保存。
CTAB/NaCl法提取的DNA纯度较高,蛋白杂质较少,保存时间长,编者更喜欢把终浓度为20μg/ml
RnaseA加在第5步温育的时候,这样最后没有RnaseA污染。每一步操作细致一些,得到的DNA可用于Southern
blot。
编者建议:长时间保存DNA可放于-20℃,但要尽量减少反复冻融,否则影响DNA质量
革兰氏阳性菌,由于细胞壁的结构与阴性菌有差别,裂解比阴性菌稍微麻烦一些,可以采取CTAB/NaCl法稍加修改,在第四步加入终浓度2mg/ml的溶菌酶,37度温育1h。
实验注意:提基因组最好要将枪头尖剪掉(剪掉以后在酒精灯上迅速过一下,使其断口圆滑)。以免枪头损伤基因组!抽干时最好是风干!

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