全基因组关联研究或能提高疾病预测的准确性
(2009-10-14 17:05:59)
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分类: 基因生物资料 |
来源:生命经纬
美国费城儿童医院一个由Hakon
全基因组关联研究(Genome-wide
据论文作者说,目前,许多疾病的致病主要基因仍然未被发现,而一些研究也只是有选择性的选取小部分基因变异体进行研究,所以研究结果有很大的局限性。在近期的一些研究中,研究人员通常利用曲线下面积
Hakonarson研究组拓宽基因变异体的研究范围,广泛的收集疾病的标记物(其中也包括许多未被证实的标记物),从而获得某个疾病相关基因之间的统计阈值,虽然这种方法不能排除假阳性的存在,但总体来说能够提高预测结果的准确性。
研究人员将该计算机程序应用到1-型糖尿病GWAS资料组,并建立了一个评估模型。与对照组相比,该模型评估的精确度显著提高,AUC达到0.8以上。此外,研究人员还强调,选择合适的疾病研究对象也非常重要,由于1-型糖尿病具有高度遗传性,其主要组织相容性复合体区域有许多疾病发病易感性基因存在。而且,这种疾病风险评估模型不适用于大规模基因扫描,而只适用于评估患一类疾病的患者。