《划拨土地使用权管理办法》（国家土地管理局令第1号）规定按不低于标定地价的40%补交土地出让金和《协议出让国有土地使用权规定》（国土资源部令第21号）的协议出让最低价不得低于基准地价70%是否矛盾？应该如何理解？

两个规定并不矛盾。1992年的国家土地管理局1号令第26条规定，划拨土地使用权人补缴土地出让金应按标定地价的一定比例收取，最低不得低于标定地价的40%。国土资源部21号令规定，协议出让最低价不得低于新增建设用地的土地有偿使用费、征地（拆迁）补偿费用以及按照国家规定应当缴纳的有关税费之和;有基准地价的地区，协议出让最低价不得低于出让地块所在级别基准地价的70%。协议出让的出让金低于最低价时国有土地使用权不得出让。

     可见，标定地价属于宗地价格，应当根据宗地条件评估确定；协议出让最低价属于区域控制价格，应分用途、区域确定，并按规定公布，而不是在具体宗地出让时临时评估确定。

    对于原划拨土地使用权人补办出让手续、补交出让金的情况，由于协议出让最低价对应的土地条件和基准地价内涵一致，即五通一平或三通一平等，鉴于原划拨土地使用权人已经支付了土地征用、拆迁补偿和前期开发等费用（即划拨土地使用权价格属于原土地使用权人的合法权益），因此，应进行土地条件修正，应当将其补交的价款（不低于标定地价的40%）与划拨土地使用权价格（同地段征地、拆迁补偿和前期开发费用等）之和作为土地使用权出让金总额，以此与同地段同用途的协议出让最低价标准（不低于基准地价70%）进行比较。