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消化病学领域内基因芯片技术的应用(二)

(2010-03-18 12:27:37)
标签:

基因芯片

barrett食管

食管癌

微阵列芯片

健康

分类: 医学临床诊断与科研服务芯片

消化病学领域内基因芯片技术的应用(二)
二、食管

食管病变基因表达谱的分析

    食管癌的诊断一直依赖细胞形态学检查,主观判断的差别造成诊断水平的巨大差异,既影响疾病的早期诊断,更无助于判断化疗的效果及疾病的预后。基因芯片技术通过大批量基因筛选,有望建立基于基因表达水平的客观量化指标。某些研究已取得了初步的成果。Lu等应用cDNA芯片筛查了正常黏膜组织、轻度不典型增生、中度不典型增生、原位癌(CIS)和鳞状细胞癌等5个级别食管病变组织细胞基因表达谱的改变。通过聚类分析发现了一批与食管癌发生发展有关的基因。杂交的结果经逆转录PCR证实。提示基因芯片技术有望成为食管肿瘤的早期诊断工具。

    美国Maryland大学医学院消化肿瘤中心Xu等采用cDNA基因芯片分析包括Barrett食管、组织化生和食管癌(鳞癌和腺癌)组织基因表达谱改变的差异,对芯片杂交结果用C1usterTreeView软件进行聚类分析,结果从8 064项基因克隆中筛选出160项在Barrett食管和食管癌中表达差异的基因,用这些表达差异基因的组合对Barrett食管和食管癌区分诊断价值与经典的Artificial Neural Networks(ANNs)方法相当。该实验室的Selaru等用含用8 000项基因克隆的基因芯片分析了7例食管癌和6Barrett食管的基因表达谱差异,芯片杂交数据的聚类分析将基因表达特征归于两个类属。其中一个类属包含所有的食管癌组织,而另一类属包含所有的食管癌前病变组织。表明基因表达谱芯片可以用来筛选有诊断意义的基因标志物。肿瘤发生是包含多基因改变的复杂过程,分析癌前病变与癌变组织多基因表达水平的差异是理解这一过程内在变化机制的途径之一。北京医科大学和中国医学科学院的Lu等采用cDNA基因芯片杂交技术分析了正常食管黏膜和异常食管黏膜组织间的基因表达谱改变。研究采用的人结肠黏膜组织按组织形态学特征分为5级,即正常、轻度不典型增生、中度不典型增生、原位癌(CIS)和食管鳞状细胞癌(SCC)。结果,包括某些已知与癌发生有关基因在内的许多基因在4种异常食管黏膜组织中均有不同程度的异常表达(上调表达或下调表达)。经过聚类分析,确定了一批与癌发生有关的基因。部分基因半定量PCR结果与芯片结果一致。研究表明基因芯片技术对研究食管癌发生发展的分子学机制是非常有用的。可以提供食管癌早期诊断的分子学分类的基因变化信息。

    基因芯片技术在判断食管肿瘤预后、考察化疗效果等方面也显示出客观、高效、准确的优势。Kihara等用9 216条基因组成的基因表达谱芯片观察食管癌辅助化疗后的疗效。从20例应用同一化疗方案治疗的食管癌患者手术癌组织标本中寻找与术后生存有关的基因。发现食管癌组织中大约有52个基因与术后生存率和辅助化疗敏感性有关。根据芯片杂交的结果分析,制定了基于不同基因表达水平的化疗反应性积分。并指出基因化疗敏感性积分与患者的预后有显著相关性。故认为基因芯片技术在判断不同患者辅助化疗和预后方面存在着巨大的应用潜力。【提供服务:生物芯片整体解决方案、兽药残留芯片检测系统;生物芯片扫描仪等仪器;耳聋基因芯片、乙肝病毒耐药检测芯片、抗核抗体检测蛋白质芯片、结核分枝杆菌耐药检测芯片、G+细菌鉴定与耐药检测基因芯片等;食源性致病微生物检测试剂盒、兽药残留芯片检测试剂盒等;HLA基因分型检测方案、血小板基因分型;人类全基因组寡核苷酸微阵列芯片服务、家蚕全基因组寡核苷酸微阵列芯片服务、人肿瘤相关基因寡核苷酸微阵列芯片服务、miRNA微阵列芯片服务、DNA甲基化谱检测寡核苷酸芯片服务等;合作共建研究中心服务、生物芯片实验室建设服务、科研课题研究服务;糖尿病超强化治疗技术应用项目合作。请联系索取详细产品和服务介绍资料:医学与生命科学服务中心暨虫洞(北京)卫生科技有限公司,戴天岩  主任、总经理,手机:13051069337,E-mail:davad311@126.com,msn:davad311@hotmail.com,qq:104974415,虫洞医学与生命科学网http://blog.sina.com.cn/cnyr

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