遇到这个问题的原因是使用junction软件将C盘空间进行映射，以节省C盘空间。

其他软件都能正常使用，但在Sql server打开服务时，提示错误3：找不到系统指定的路径。

可能是由于junction引起的问题，但不确定。解决方法如下：

1.命令行中，打开C盘下的program files(即SQL安装路径)；

2.使用命令查看详细的路径缩写：c:>program files>dir/x

http://s16/bmiddle/5420e000tb63bc12535af&690server遇到找不到系统指定的路径" TITLE="SQL server遇到找不到系统指定的路径" />

3.在注册表中将该项名称进行替换即可：

http://s8/bmiddle/5420e000tb63bc68a1a67&690server遇到找不到系统指定的路径" TITLE="SQL server遇到找不到系统指定的路径" />

注册表找到HKEY_LOCAL_MACHINE/SYSTEM/CONTROLSET001/Services/MSSQLSERVER ,找到这个后选中ImagePath, 双击ImagePath,把它的数据数值修改成正确的可执行文件路径c:\xxx\...\sqlservr.exe。
    然后启动服务，OK。

相似问题解决参考：

http://blog.sina.com.cn/s/blog_610f242e0100qor5.html