HZI科学家通过国际合作破译了马的基因组

09年11月9日

遗传基因决定了每个生物活体组织的所有生长发育进程。截止2006年，有亥姆霍兹感染研究中心人员(HZI)参加的科研人员已经破译了人类的遗传密码。一个国际科学家协作团队现再又成功地破译了马的遗传结构，这次同样也有由赫尔穆特．布诺克(Helmut Blöcker)率队的HZI基因组学分析部的参与。该结果发表在最新一期的《科学》杂志上。
这个项目起源于2006年8月下萨克森州州长在柏林举办的“马的家乡下萨克森州”展览会上的开幕发言。她吁请汉诺威兽医大学校长联系HZI的基因组学科研人员，共同启动“马基因组学”项目。美国的布诺德研究所也全面介入了这个项目。

这个三方协作组有明确的任务分工：布诺德研究所和其他机构负责提供特别处理和准备的马的DNA。汉诺威兽医大学的团队以及HZI的团队则负责测序以及最后组装被打乱的基因组片段。“目前从技术上还能不做到一次性地把全部基因整体地测量出来。所以我们所处理的都是被切割成成随意大小的DNA片断”，赫尔穆特．布诺克说。他的研究团队负责的是要从总体上确认基因组学中数十万个DNA片段之间的排序：马的基因组图谱究竟看上去什么样？ HZI的团队并不是分析DNA片段的全链，而只是其末端。他们的责任是要找出哪些片断的末端具有相同序列的DNA单元。相同的序列意味着这些片断是相互对应的。“人们可以类似地想像两排砖头，只有当它们以某种方式可以罗列在一起的时候，才能无缝地被连起来”，布诺克说，“我们所面对的DNA片段也是如此。”研究人员采用了测序设备，可以存储大量的碱基序列的数据。HZI的科研人员可以通过生物信息学处理这些海量数据，然后用于不同的目的。布诺德研究所也用大量的自己的数据填充了不伦瑞克的末端与末端间的空白，从而诞生了无缝拼接的全基因组序列。

其结果是：人与马之间的基因相似性超过预期。赫尔穆特．布诺克说：“如果逐个染色体对染色体比对人与马的基因组，非常相近的基因占到大约一半左右。而在把人与狗作比较的时候，大约只有百分之三十。”

今后科研人员将借助所采集的这些数据，从分子水平上研究马匹的健康。人类也可以从中受益：人与马患有某些近似的疾病，例如过敏。这些新发现有助于科研人员进一步了解疾病的成因，从而开发新的治疗方案。

原始文章： Genome Sequence, Comparative Analysis, and Population Genetics of the Domestic Horse. Wade CM, Giulotto E, Sigurdsson S, Zoli M, Gnerre S, Imsland F, Lear TL, Adelson DL, Bailey E, Bellone RR, Blöcker H, Distl O, Edgar RC, Garber M, Leeb T, Mauceli E, MacLeod JN, Penedo MC, Raison JM, Sharpe T, Vogel J, Andersson L, Antczak DF, Biagi T, Binns MM, Chowdhary BP, Coleman SJ, Della Valle G, Fryc S, Guérin G, Hasegawa T, Hill EW, Jurka J, Kiialainen A, Lindgren G, Liu J, Magnani E, Mickelson JR, Murray J, Nergadze SG, Onofrio R, Pedroni S, Piras MF, Raudsepp T, Rocchi M, Røed KH, Ryder OA, Searle S, Skow L, Swinburne JE, Syvänen AC, Tozaki T, Valberg SJ, Vaudin M, White JR, Zody MC; Broad Institute Genome Sequencing Platform; Broad Institute Whole Genome Assembly Team, Lander ES, Lindblad-Toh K. Science 6 November 2009: Vol. 326. no. 5954, pp. 865 – 86. DOI: 10.1126/science.1178158