Sequenom质谱法分析DNA甲基化

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健康 |
用Sequenom的质谱法来检测DNA甲基化,是一种较为常用的分析较少位点甲基化状态的方法。原理详见长微博。
原理:
- 亚硫酸氢盐处理目标DNA,把没有甲基化的C统统转化成U
- 用带P7启动子的PCR引物扩增目标片段
- 扩增的片段再通过P7启动子转录出RNA
- NA用针对U碱基的特异裂解酶进行打断
- 打断后的片段用质谱进行检测的
- G碱基比A碱基重16个质量数
- 如果原来是甲基化的C,质谱中会检出G
- 如果原来是没有甲基化的C,质谱中会检出A
- 根据含G峰和含A峰的面积比较,可以推断出原来的样本中有多少是甲基化的,又有多少是没有甲基化的
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