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Sequenom质谱法分析DNA甲基化

(2014-04-24 00:52:24)
标签:

健康

用Sequenom的质谱法来检测DNA甲基化,是一种较为常用的分析较少位点甲基化状态的方法。原理详见长微博。

原理:
  • 亚硫酸氢盐处理目标DNA,把没有甲基化的C统统转化成U
  • 用带P7启动子的PCR引物扩增目标片段
  • 扩增的片段再通过P7启动子转录出RNA
  • NA用针对U碱基的特异裂解酶进行打断
  • 打断后的片段用质谱进行检测

  1. G碱基比A碱基重16个质量数
  2. 如果原来是甲基化的C,质谱中会检出G
  3. 如果原来是没有甲基化的C,质谱中会检出A
  4. 根据含G峰和含A峰的面积比较,可以推断出原来的样本中有多少是甲基化的,又有多少是没有甲基化的

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