无论是动物蛋白还是植物蛋白，过量均会对人体造成损害，而尤其是动物蛋白对人体的损害更大．首先含蛋白多的动物食品基本上都含有较多的动物脂肪，多数是饱合脂肪，这些脂肪百分之九十五都会被人体吸收用于做功或者储存起来．过多必然就会致肥胖，同时也会致脂肪代谢的异常，增加脂肪肝及血脂的异常发生率．
其次正常情况下人体不贮存蛋白，所以必须将多余的蛋白质代谢排出体外，最重要的排出途径就是脱氨分解后通过尿液排出．这一过程需要大量的水份，从而加重了肾脏的负荷，若肾功能不全，则危害更大．
过多的蛋白质需要进过肝脏进行脱氨基代谢，会加重肝脏的负担．特别一些肝功能有异常的人更应该注意，特别是肝硬化的病人更应该在营养师和医生的共同指导下进行科学的饮食．
动物蛋白过多还会导致骨质疏松．第一尿液排出更多，更多的钙排出，第二钙与含硫氨基酸的结合加速了钙质的丢失．
另过多的蛋白质也会致血液的酸性化．