副“总统”当选人萧万长在台北接受日本读卖新闻专访，对于台日间多次争议的钓鱼岛主权问题，因袭李登辉、陈水扁时代的主张，认为“牵涉到主权争议的问题应暂时搁置，让双方都能够获得利益，不要因此影响到台日关系”。

　　联合报报道，萧万长这项主张与“总统”当选人马英九争取渔权主张明显不同。

　　台湾主张对钓鱼岛享有主权，也一直希望解决钓鱼岛海域的渔权争执。马英九对钓鱼岛主权问题立场一向强硬，萧万长受访提出“搁置争议”看法，是否代表马英九“对日强调主权”的想法转向，受到关注。

　　去年十月廿九日，马英九在宜兰县南澳与渔民座谈，渔民激动陈情表示，日本声称拥有台湾东南方冲之鸟岛主权，自订两百浬经济海域，并据此逮捕台湾“越界”捕鱼渔民，渔民苦不堪言，但日本不愿与台湾政府谈判渔权。

　　马英九说，“我们不侵略别人，但也不容许别人侵略我们”，若不如此，与日本永远谈不出结果；这不是为了报复，台湾本来就有权自卫，如果不这么做，有什么尊严可言？马英九承诺当选后会在合理范围内争取渔权，确定台湾的经济海域。马英九当时还痛批陈水扁整天谈“主权独立”，却吝于为渔民争取尊严，“尊严不是嘴巴喊的，要拿出力量才有尊严。” 

　　对于与日本关系的发展，萧万长接受读卖访问时还表示，会继承民进党留下来的台日关系，并继续发展。

　　他表示，希望与日本签订经济合作协定（EPA），也期待松山机场未来能与日本东京都羽田机场连结，建立起两个点之间迅速往来的“穿梭航线”。