(三) Sxl基因是主开关

在果蝇囊胚形成前或形成时，通过对性指数的计量决定是否打开Sx1基因。Sx1基因是性别决定的总开关，它能永远保持在“开”和“关”的状态。当X:A转录因子浓度达到一定时（X:A=1.0），Sxl基因处在“开”的状态。而在雄体中X:A=0.5转录因子未能达到一定的域值，Sx1基因处于关闭状态。

Sx1基因有早期和晚期两个启动子（PL和PE）和8个外显子，在第2个外显中有翻译的起始密码子AUG，而在第3和第8个外显子中有终止密码子UGA。早期起动子是调节型的，由母体效应基因，分子、分母因子共同调控。这个启动子开始的转录是选择性的，即可以跳过第3个外显子，这样也就避免了中途的终止密码子，使翻译可以一直达到最后一个外显子中的UGA，产生有活性的Sx1蛋白（350aa 组成）。囊胚形成后X:A转录因子和母体效应基因的产物已不复存在，PL再已不能被激活，而晚期启动子PE是组成型表达的，无需母体基因及分子、分母因子的调控、激活，所以可在两种性别的囊胚形成后开始表达，Sx1蛋白含有一定浓度的碱性氨基酸，是一种RNA-结合蛋白，它可以改变晚期启动子产生的Sx1初始转录本的剪接，在雌果蝇中由于已存在早期启动子合成的Sx1，因此可以对晚期启动子的mRNA进行适当剪接，从而能产生有活性的Sx1，这就是Sx1的自我调节的功能。这样Sx1的活性在雌体中得到了维持。

雄体（X:A=0.5）其Sx1早期启动子无法被激活，也就不能产生Sx1蛋白，而晚期启动虽能启动，但初始转录物就不能得到Sx1的适当剪接，第3个外显子也被转录，这样在起始点不远的位点就出现了终止密码，这便是雄性特异性的mRNA，只能产生一个很短没有功能的Sx1多肽。

在雌体中Sx1的自我反馈调节维持Sx1的正常表达起到了重要的作用。但还有其它的基因也涉及到维持Sx1的表达，如男性化基因vir（virilizer,），老处女基因snf（sans  fille,），它们突变后Sx1因不能维持高水平的表达而阻滞雌性发育。还有一个母性效应基因叫做雌性致死fl(2)d（female-lethal-2d,)基因。其突变会影响到Sx1晚期转录的雌性特异剪接。

(四) Sx1控制体细胞性别分化基因。

在果蝇性决定的途径中在Sx1下游的还有tra，tra-2，双重性别基因dsx（doublesex）间性基因ix（intersex）,两性基因her（hermaphrodite）和不育基因fru（fruitless）等。

Sx1直接的靶基因是tra基因，tra在两性的发育中均被转录，但只在雌果蝇中产生有功能的Tra蛋白，Sx1蛋白的存在可以改变tra基因转录本的剪接。一种剪接方式在雌雄两性中都存在，那就是没有Sx1的指导，产生的RNA的前部含有终止密码子。最终产生的Tra蛋白是没有功能的。在部分雌体细胞中Sx1

蛋白的存在与tra mRNA前体相作用，结合在非性别专一性，3＇端剪接位点附近抑制了通常使用的非性别专一的3＇端剪切位点，当这个位点被跳越过时，便使用下一个第3个外显子中含有的UGA，结果使约一半tra mRNA前体，产生雌性特异性剪接，形成包括全长ORF的成熟的mRNA，这种mRNA编码有活性的Tra蛋白。

Tra-2基因有多个起始位点和多腺苷加尾位点，加上选择性剪接，就能产生很多不同的相关RNA，编码一系列相关蛋白，这些蛋白都含有Arg-Ser富集区和一个RNA识别区域（RRM），这是几个已知的作为RNA剪接因子的RNA 结合蛋白的特点之一，表明  tra-2的功能也与RNA剪接有关。有些tra-2 RNA只存在雄性生殖细胞中，为正常精子发生所需，此和性别决定无关。另一些tra-2的产物在两性的体细胞中都存在，无性别差异，而只有在Tra蛋白存在对Tra-2蛋白才显示出影响性别分化的功能。Tra可能通过与Tra-2形成某种复合体的形式共同作用，通过对dsx的mRNA前体的雌性剪接，表达为雌性异的DsxF，从而进一步控雌性化发育。

dsx座位有两种彼此排斥的表达方式，在雌性中在Tra和Tra-2的作用下，dsx的mRNA初始转录本中从内含子的5＇到其3＇端被切除，结果翻译终止于外显子4未端的UAG处，形成一个较小的蛋白DSXF；在雄性中Tra蛋白无功能，Tra-2不能与其形成复合物，dsx的剪切也就不受二者的影响，从内含子3的5＇端位点直接到内含子4的3＇端，这样将含有终止密码子的外显子4也切除了，使翻译一直进行到第6个外显子，产生一个较大的DSXm蛋 白。Tra和Tra-2调节的作用和Sx1有2点不同：（1）前者使剪接的结果存在中途的终止位点，而后者相反切除了中途终止位点，使蛋白有功能； （2）Tra和Tra-2在两性中不同的剪接虽也产生不同的蛋白，但都有活性，仅功能不同。而Sx1的作用结果是产生有活性的Sx1和TRA,而没有 Sx1指导的剪接，Sx1和Tra都没有活性。

两性基因ix（interser,）目前了解不多，经遗传分析表明ix产物可与Dsx相互作用，在雌蝇中促使DSXF对雄性分化起抑制作用，是雌性分化所需的基因。her基因是母体温度敏感基因，它在果蝇性别决定途经的前、后两个位置上，都起到调节作用。其本身是一种具有锌指结构的转录因子。在途径的后部与Ix作用的位置相同。