1959年初随着全国产业队的逐步撤销，由中国红旗体协足球队改称并全队下放上海仪表厂的上海三队（上海市体委统一编制）获得了华东协作地区五省一市足球对抗赛的第二名，并代表徐汇区队夺得了上海市第二届运动会足球比赛的冠军，证明了他们仍然是在上海自1956年以来唯一可以和上海一队抗衡的一支国内足球强队。

而上海一队由于在第一届全运会足球决赛阶段的表现未如人意，导致了上海足球球员资源进行了一次整合，代表上海队参加全运会的四名战将中徐同华、胡南海、高建云回归上海三队，而锋线尖刀陈志华正式加盟一队，另外原中国红旗队最锐利的武器----张正友在被迫离开球场一年多后也正式转入上海一队。

上海三队除上海全运会三将外，仅保留了郑世龙、吕宝根、邵惠中这几员老将，吸收了原上海一队、二队、五队等球队的一些球员，他们是王兆龙、王忠勇、蒋国良、李勤良、赵锦镛、毛洪福、陈正华、杨震江、曹宪秋、毕新华、沈百康和守门员徐财宝，两位老将王兆龙、邵惠中兼任教练，总的来看，球队老中青各占三分之一，人员较原中国红旗队更为齐整，不过少了张正友和陈志华，球队的攻击力肯定是折损了不少。他们在1960年参加了如下比赛：

 

1960年1月1日上海  上海三队 1-2 全国冶金队

全国冶金队1959年后落户上海钢铁一厂，由上海和北方的好手组成，实力不俗。三队此战未能占得便宜，以一球落败，为三队进球的是老将胡南海。

 

1960年1月3日上海江湾体育场  上海三队 0-2 河北青年队

河北青年队1958年6月由天津组建，1959年以河北青年队名义获得了全国青年冠军赛的冠军。在60年代一直是我国甲级劲旅，是河北省足球的代表。面对这支骁勇的青年军，尚在磨合中的三队依然未能取得胜绩。

 

1960年1月24日上海杨浦体育场  上海三队 0-3 北京体育学院二队

北京体院二队由在首届全运会上表现出色的青年选手选拔组成，圈内也称作国家青年队，由陈复赉、方纫秋执教。当日下午杨浦场上积冰融化，场上一片泥泞，开赛不过几分钟，体院二队右内锋孙云山左路突破后晃过补位的王文浩，面对门将将球打入；之后孙云山开出任意球，三队杨震江顶球不远，文贞伍斜传，程洪森冲入一击得手；48分钟程洪森边路传中造成门前混乱，孙云山打空门得分。三队本场比赛虽然大比分落败，但在场上特别是上半场攻势还是很猛烈。本场比赛双方排阵如下：

 

上海三队	北京体育学院二队
徐财宝 GK	马克坚 GK
陈振华 RB	徐辅臣 RB
吕宝根 CB	高筠时 CB
王兆龙 CB	杨虞雄 CB
杨震江 LB	孙玉明 LB
高建云 RM	宋恩牧 RM
赵锦镛 LM	文贞伍 LM
蒋国良 RW	程洪森 RW
徐同华 IRF	池云峰 IRF
邵惠中 ILF	孙云山 ILF
胡南海 LW	孙霞丰 LW

 

 

1960年1月28日上海沪西体育场  上海三队 0-0 沈阳部队队

 

1960年2月21日上海黄浦体育场  上海三队 0-0 沈阳体院队

 

1960年2月27日上海淮海运动场  上海三队 1-0 八一青年队

 

1960年3月5日上海沪西体育场  上海三队 - 北京青年队

 

 

1960年的全国甲级队联赛进行了扩容，参加甲级队比赛的26个队为1958年的12个甲级队、1958年乙级队联赛前四名、1959年进入首届全运会决赛阶段的北京、黑龙江、陕西、江苏等四个省级队以及当时青少年基础较为雄厚的河北（天津）、上海、广东、八一、辽宁、北京6地的青年队。比赛分为两个阶段进行，上海三队第一阶段被分在第三赛区（上海-南京赛区），该赛区共8个队，以单循环方式决定名次，上海三队赛程赛况如下：

 

1960年3月27日上海虹口体育场  上海三队 1-1 广东青年队

上海三队本场表现不错，全场占据了70%的攻势，在上半场就有5-6次必进球机会，打空门的就有三次，但一次都未能把握，到了下半场才在连续两次角球战中，由王忠勇逆风开出，亲自上阵的教头王兆龙后插上将球顶入，不过八分钟后，广东的港产右边锋李国强右边切入直达门前扳平了比分。本场比赛上海三队排出的阵容如下：

上海三队

徐财宝 GK

曹宪秋 RB

吕宝根 CB

王兆龙 CB

杨震江 LB

高建云 RM

李勤良 LM

王忠勇 RW

邵惠中 IRF

徐同华 ILF

胡南海 LW

 

 

1960年3月30日上海黄浦体育场  上海三队 0-1 北京青年队

虽然冠名青年队，但北京青年队是上年全运会季军的底子，实力强劲。上半场双方互有攻守，下半场上海三队减少中场横传，威胁立现，多次在对方门前获得良机；北京青年队此后以金竹松替出陈文方，开始逐渐活跃，他们一传一切的打法屡次打破三队防线，77分钟北京右翼诱出三队门将后轻吊门前，三队两个中卫门前推让，被北京中锋张志诚赶上一蹴而就。

 

1960年4月3日南京五台山体育场  上海三队 1-0 江苏队

上海三队转战南京，凭借赵锦镛在79分钟的入球，力克甲级新军，获得联赛首胜。

 

1960年4月6日南京五台山体育场  上海三队 2-2 南京部队队

南京部队队是老牌甲级队，阵中的盛金荣、唐世昌、金英杰都是首届全运会冠军解放军队的主将，本届联赛开局不利输给了湖北队。本场比赛双方在上、下半场分部各进一球，握手言和。

 

1960年4月10日上海江湾体育场  上海三队 1-4 辽宁队

辽宁队开赛以来状态正佳，获得连胜，本场上半场辽宁队由王有成命中点球获得领先，下半场开场后辽宁队发起猛攻，十几分钟内连得三球，其中两球是三队中卫卫回传门将过轻，被曲光新、慕厚仁后上截得攻入的，之后王有成梅开二度；三队大比分落后后并不气馁，连续发动反攻，由赵锦镛扳回一分。

 

1960年4月14日上海黄浦第一工人体育场  上海三队 0-2 天津队

天津队就是全运会亚军河北队，此前已三连胜，本场双方苦苦争持到80分钟都无建树，此时天津孙霞丰迫得角球，由胡凤山开出，门将跳起扑空，天津中卫邓雪昌将球顶向空门，在门角助守的三队教头王兆龙将球顶出，却被眼明腿长的孙霞丰赶来一脚低射入网；5分钟后陈山虎搓过吕宝根后面对出击的门将低射中右门柱而入。整场比赛上海三队踢得顽强，中场控制也不差，天津队得胜也是得于前锋较好的能力。

 

1960年4月17日上海同济大学体育场  上海三队 0-0 湖北队

两队境遇相仿，都渴望取得一场胜利，最终都无建树。

 

这样上海三队以1胜3平3负获得全国甲级队联赛第三赛区（上海-南京赛区）第五名，他们将参加5月第二阶段沈阳-旅大赛区（决定7-15名）的比赛：

 

1960年5月8日沈阳  上海三队 1-2 八一队

实力强大的八一队第一阶段接连输给上海一队和广东队，只能参加7-15名的决赛，上半场三队他们以1球领先，下半场李松风、哈增光又各下一城。

 

1960年5月12日沈阳  上海三队 3-1 河北青年队（上半场2-1）

 

1960年5月15日旅大  上海三队 0-0 南京部队队

 

1960年5月19日旅大  上海三队 2-1 黑龙江队（上半场2-0）

 

1960年5月22日旅大  上海三队 2-0 北京队（上半场1-0）

 

1960年5月26日旅大  上海三队 0-2 北京青年队（上半场0-0）

 

1960年5月29日沈阳  上海三队 2-3 全国化工队（上半场2-2）

 

1960年6月1日沈阳  上海三队 4-2 四川队（上半场3-1）

 

最终上海三队以4胜1平3负获得1960年度全国甲级队联赛第11名，这个成绩也比较客观的反映了上海三队在全国甲级队中的位置。上海三队参加联赛的名单如下：

领队	周世文
教练	王兆龙（兼）  邵惠中（兼）
号码
0	徐财宝 GK
1	郑世龙 GK
2	陈正华 B
3	吕宝根 CB
4	曹宪秋 RB
5	高建云 RM
6	王兆龙 CB
7	王忠勇 RW
8	蒋国良 IRF/RW
9	李勤良 LM
10	徐同华 IF
11	胡南海 LW
12	邵惠中 IF
13	-
14	赵锦镛 LM
15	毛洪福 RW
16	毕新华 B
17	杨振江 LB
18	沈百康 F
	-

注：联赛首发出场仍以1-11号排列

 

1960年6月19日上海虹口体育场  上海三队 4-0 上海工人队

这是上海市工人运动会开幕式上的表演赛。开赛不久三队胡南海切入门前10米处，起左脚低射，球直飞入大门左下角；55分钟胡南海掠得对方门将传右后卫的球后传中，中路蒋国良送球入空门；此后蒋国良、王忠勇巧妙配合后传向左侧，赵锦镛插入低射得分；最后三队快速反击，胡南海传中，蒋国良中路头球建功。

 

1960年8月28日上海虹口体育场  上海三队 2-1 上海一队

在已知球队将被撤编的情况下，这场比赛三队相比一队进攻速度更快，中场控制力更强。开赛三分钟，赵锦镛左侧罚球吊向门前，徐同华随球切入，抢在门将之前头敲右上角得分；17分钟后，李桂福开出角球，陈家根头球被挡，乱战中朱振芳铲抢将球碰入门内；60分钟，徐同华中场截球，右翼王忠勇右边切中带动对方后卫，而内锋蒋国良移到右侧空档接球后下底传中，王忠勇跑动中一脚不想踢漏，还好左侧赵锦镛杀至，脚起球入。

 

1960年9月1日上海黄浦工人体育场  上海三队 2-1 上海杨浦区队

比赛在高速度下进行，开赛不到5分钟，杨浦右翼吴松泉斜切中路接前卫传球，面对徐财宝挑球入网；12分钟时徐同华禁区外得球，起右脚正脚背劲射，球贴右门柱而入；15分钟三队右翼王忠勇换位至中路，接徐同华头顶二过二后再下一城。

 

1960年9月4日上海沪南体育场  上海三队 1-0 上海吴淞区队

吴淞区队由钢铁工人组成，阵中还有几员全国冶金队的骁将，他们自始至终给三队很大的威胁，尤其是下半场在中场争夺和前场攻击上都有出色的表演，只是一次防守失误而失去一球。这是上海三队被调整前最后一次公开表演。

 

早在1960年7月，上海市体委党委就向市委教育卫生部提出：鉴于上海一、三、四队不仅人数不足，而且大都年龄大，发展前途有限；青年队也是人数不多，有些条件较好的青年又分散在各队作预备员，得到严格锻炼机会较少。根据这种情况要二、三年内在争取全国冠军、亚军达到世界水平，必须迅速作一次调正，可将原四个队调整为三个甲级队。1960年8月15日中共上海市委教育卫生工作部批复同意此项提议，并决定上海三队撤销，除个别队员外其他队员分配到上海一队、上海青年队和上海工人队。