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符合结构通式的不一定就是组成蛋白质的氨基酸

(2011-08-08 13:59:51)
标签:

杂谈

分类: 边学边记

 几乎每年的复习资料上都有下面这个题,可从未看出有什么不妥。这几天重读王镜岩等主编的《生物化学》,终于看出了问题——题中的虽然符合组成蛋白质的氨基酸的结构通式,但它根本就不是组成蛋白质的氨基酸!

符合结构通式的不一定就是组成蛋白质的氨基酸符合结构通式的不一定就是组成蛋白质的氨基酸
   

    ①、②、④都符合组成蛋白质的氨基酸的结构通式,它们都是组成蛋白质的氨基酸吗?相信很多人和我以前一样会深信不疑。可以事实上答案却是否定的。题中①是天冬氨酸,②是半胱氨酸,是鸟氨酸;天冬氨酸和半胱氨酸都是组成蛋白质的氨基酸,可鸟氨酸不是。在组成蛋白质的20多种氨基酸中,与鸟氨酸结构最接近的是赖氨酸和精氨酸,下面的结构式显示了它们结构上的的区别:

符合结构通式的不一定就是组成蛋白质的氨基酸符合结构通式的不一定就是组成蛋白质的氨基酸


    鸟氨酸是精氨酸(组成蛋白质的氨基酸之一)的衍生物,在肝脏中精氨酸可以由精氨酸酶水解为鸟氨酸和尿素。鸟氨酸是尿素循环的中间物,它并不参与蛋白质组成,属于非蛋白质氨基酸。它在尿素循环中所起的作用类似草酰乙酸在三羧酸循环中的作用,一分子鸟氨酸和一分子氨及二氧化碳结合形成瓜氨酸(它也是非蛋白质氨基酸),瓜氨酸与另一分子氨结合形成精氨酸,精氨酸水解形成尿素和鸟氨酸完成一次循环。

 这就是说,组成蛋白质的氨基酸都符合结构通式(脯氨酸是一个例外),但符合结构通式的物质并不一定就是组成蛋白质的氨基酸!道理很简单:组成蛋白质的氨基酸只有20多种,而符合这个结构通式的化合物却有很多很多。做题的学生我们当然不要求他们知道这些,但出题的老师就不同了,你出的题中不应该出现科学性错误!

在我们的模拟题中这样的问题并不鲜见,现在让我们再来看一个例子:

符合结构通式的不一定就是组成蛋白质的氨基酸

符合结构通式的不一定就是组成蛋白质的氨基酸

符合结构通式的不一定就是组成蛋白质的氨基酸

符合结构通式的不一定就是组成蛋白质的氨基酸

这个题的图2错得更离谱,4个氨基酸的R基写在那里,我只认出④、⑥分别是丙氨酸和天冬氨酸的R基,以②、⑧作R基的氨基酸不仅不是组成蛋白质的氨基酸,甚至在生物体内能找到的非蛋白质氨基酸中也没有它们啊!可见,图2并非是某种蛋白质的肽链结构的局部放大,它纯粹是命题者凭空捏造的。

这件事情给我们一个教训:对待科学的问题必须要有科学的态度,来不得半点马虎。

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