作为现今北京城内为数不多的藏传佛教寺院之一，北京妙应寺始建于元至元八年（1271年），是由元世祖忽必烈亲自勘查选址敕令建造的，时称“大圣寿万安寺”。作为忽必烈的家庙，成为元朝皇族祭祀祈福的活动中心。“万安寺”地位十分崇高，其殿内陈列设计都要忽必烈亲自过问，在“人烟百万”的元大都城，香火鼎盛百年，同时它也是最早翻译维吾尔文和蒙文佛经的场所。

　　新中国成立后白塔寺受到了党和政府的重视和关怀，寺内大批文化遗产得到了妥善的保护。1961年3月4日，寺内白塔被列为全国第一批重点文物保护单位。1972年3月，周恩来总理亲自批示：“同意修缮白塔寺，不作为庙宇，只作为古迹看待，专供游览。”1980年3月，成立“北京市白塔寺文物保管所”。

　　现在，北京市白塔寺管理处隶属于北京市文物局，也像其他文物保护单位一样，其功能转变为为弘扬优秀的民族文化传统、为建设社会主义精神文明服务，从而获得了新的生机。