代谢组学(GC-MS,LC-MS,NMR)全面解决方案【转】

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代谢组学(metabonomics/metabolomics)是研究关于生物体被扰动后其代谢产物(内源性代谢物质)种类、数量及其变化规律的科学。代谢组学着重研究的是生物整体、器官或组织的内源性代谢物质的代谢途径及其所受内在和外在因素的影响及随时间变化的规律。作为基因组、转录组和蛋白组的“终端”,能够更直接、更准确地反映生物体的病理生理状态。作为全局系统生物学的基础和系统生物学的一个重要组成部分,代谢组学是以物理学基本原理为基础的分析化学、以数学计算与建模为基础的化学计量学和以生物化学为基础的生命科学等学科交叉的学科。
一、技术路线和方法:
http://s1/mw690/a33d1284gccb4b3392590&690
二、生物信息学分析
2.1
Part01:数据预处理
Part02:PCA分析
Part03:PLS-DA分析
Part04:OPLS-DA分析
Part05:差异化合物筛选
Part06:差异化合物鉴定
2.2
Part07:多组分关联分析(同一标本同时取多组分)
Part08:代谢通路分析
Part09:多组学数据关联分析(具备多组学数据)
三、样品要求
3.1
Ø
Ø
Ø
3.2
血清:
1)
2)
3)
(2)取血时如用麻醉剂,建议用异氟醚,防止在NMR血清谱图中出现干扰峰。
(3)如要采用血浆,请务必使用肝素钠抗凝管。
尿液:
1)
2)
其他种类的样品在收集之前请联系公司销售工程师。
四、代谢组学平台
代谢组学平台 |
型号 |
厂商 |
货号 |
LC-MS |
ACQUITY UPLC/Micromass Q-TOF Premier MS |
Waters |
BT4000111 |
GC-MS |
7890A GC/5975C MS |
Agilent |
BT4000121 |
GC×GC-TOF MS |
Pegasus 4D |
LECO (USA) |
BT4000122 |
NMR |
Varian Inova 600M |
Agilent |
BT4000131 |
Bruker |
Bruker |
BT4000132 |
五、完成时间
NMR2个月,质谱3个月,(其中生物信息分析1个月)
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