1.江宁汤山史前遗址区，保护范围面积约0.8公顷。

　　2.高淳薛城史前遗址区，保护范围面积约4.69公顷，保护范围南到农具厂南围墙，东到水塘，北、西到稻田。

　　3.清凉山石头城遗址区，时代：三国，保护范围面积约183.13公顷，保护范围：东至西康路、虎踞路一线，南至龙蟠里，西至秦淮河，北至北京西路。

　　4.六朝宫城及御道遗址区，时代：六朝，保护范围面积约608公顷，保护范围：北至北京东路，东至龙蟠中路、秦淮河一线，西至丹凤街、估衣廊、明瓦廊一线，南至白下路。

　　六朝宫城及御道遗址区——西州城、东府城 时代：六朝。

　　西州城的保护范围面积约29.28公顷；保护范围：北至秣陵路，东至丰富路，南至秦淮河，西至王府大街。

　　东府城保护范围面积约17.85公顷，北至尚书里，东至解放路，南至护城河北岸，西至解放路西侧400米。

　　5.南唐宫城及御道遗址区 时代：南唐，保护范围面积约145.4公顷，北至淮海路，南至升州路、建康路一线，西至明瓦廊、评事街，东至太平南路。

　　6.明代宫城及御道遗址区，时代：明代，保护范围面积约502.63公顷。东至明城墙、护城河，南至瑞金路、后标营，中部以御道街向两侧延伸220-270米(西侧至瑞阳街，东侧至蓝旗巷一线)，西至龙蟠中路、秦淮河一线，北至省青年干部学院、五十四中一线(原复兴桥及原皇城城缘遗址)。

　　7.内秦淮河两岸十朝遗存区 时代：历朝遗存。保护范围面积约268公顷。北至升州路、建康路，南至内秦淮河南侧150米、双塘路、仙鹤街、水斋庵、外秦淮河北岸、平江府路、箍桶巷一线，西侧至凤台路，东侧至龙蟠中路。

　　8.六朝陵墓区——仙林六朝陵墓区 时代：六朝 保护范围面积约6427.89公顷 北至乌龙山路、杨家边路、南龙路一线，东、南至九乡河，西至沪宁铁路以北绕城公路，以南至土城头路。

　　六朝陵墓区——晋西陵、晋东陵遗址区 时代：东晋 晋西陵保护范围面积约67.91公顷，北至渊声巷，南至汉口路，西至上海路，东至中山路。晋东陵保护范围面积约41.79公顷，西至龙蟠路，南至农场巷，东至明城墙，北至富贵山北麓林区路。

　　9.幕府山古墓葬群区 时代：六朝，保护范围面积约：1525.24公顷，东至和燕路，南至北固山路，西至金燕路，北至幕燕滨江路。

　　10.雨花台古墓葬群区 时代：六朝、宋代 保护范围面积约594.73公顷，北至纬八路，东至宁溧公路，西至宁丹路，南至宁南大道。

　　11.铁心桥古墓葬群区 时代：六朝，保护范围面积约1108.38公顷，北至纬八路，东至宁丹路，西至宁芜公路，南至宏运大道。

　　12.西善桥古墓葬群区 时代：六朝，保护范围面积约315.9公顷。具体可分为三部分，其中西侧片区北至宁芜铁路，南至梅山中心路，西至天保路，东至417公路。东侧片区北至铸造厂路，东、南至管道路，西至大宝圩村民路。南侧片区北至大周路，南至将军山北麓。

　　13.板仓街明代开国功臣墓葬区 时代：明代 保护范围面积约588.23公顷。东至经五路，南至由板仓街向紫金山延伸800米一线，西至龙蟠路，北至312国道。

　　14.长干里古居民区及越城遗址区 时代：春秋 保护范围面积约102.45公顷。北至秦淮河北岸，南至应天大街，东至晨光路，西至凤台路。

　　15.江宁将军山明代沐英家族墓地区 时代：明代 保护范围面积约81.14公顷，位于将军山南麓，东至沐英水库，西至220kv高压线沿线，南至佛城西路，北至韩老洼水库。