肃南的海拔比张掖要高许多，只要张掖刮风，马蹄寺必定下雨。所以多雨季节避免游览，去马蹄寺是一直大幅度的升海拔，到了马蹄寺之后去格萨尔王殿还要经过一段砂石路，如果下雨车几乎是上不去的。游览最好选择在秋季，路边的景色变化大，石窟也赋予了特殊的活力，夏天也可以，但是避开雨天。春天风沙大，看石窟不太适合。还有重要的一点，下午两点之后到马蹄寺游览票价减半。