马蹄寺寺院自建寺以来，香火就极为鼎盛，最盛时的僧众可达1000余人，而建国初期僧众也尚有50余人，足可见历史上马蹄寺的辉煌。

文革时期，马蹄寺再一次遭到严重破坏，不仅寺中石窟、壁画、佛像几乎被毁坏殆尽，就连石窟外的建筑都荡然无存。

可以在马蹄寺裕固族帐篷内欣赏到裕固族欢快热情的草原歌舞，并品尝独特的银碗美酒和手抓羊肉。