在学术和学术思想上，傅山的学问文章，都追踪当时的进步思潮，尤其是前半生明朝末亡之时，他的思想带有强烈的进步倾向，不重视当时学者重理学的倾向。他赞扬具有革命新精神，被明朝统治者视作洪水猛兽的李贽学术思想和刘辰翁、杨慎、钟星等节高和寡之士的文风。对明末的政治腐败，官场龌龊，是有清醒的认识。清军入关明王朝灭亡后，傅山一反清初一般学者以经学为中心的研究范围，而是独辟研究子学的途径，冲破宋明以来重理的羁绊，开拓了新的学术研究领域，成为清之后研治诸子的开山鼻祖。至于傅山的诗赋，则是继承了屈原、杜甫以来的爱国主义传统，他主张诗文应该“生于气节”，以是否有利于国家和民族为衡量标准。傅山一生著述颇丰，可惜所著宏论，大都散失，只存书名和篇名，留存于世的仅《霜红龛集》和《两汉人名韵》两部。
    在诗、文、书、画诸方面，傅山皆善学妙用，造诣颇深。其知识领域之广、成就之大，在清初诸儒中，无出其右者。傅山的书法被时人尊为“清初第一写家”。他书出颜真卿，并总结出“宁拙毋巧，宁丑毋媚，宁支离毋轻滑，于直率毋安排”的经验。他的画也达到了很高的艺术境界，所画山水、梅、兰、竹等，均精妙，被列人逸品之列。《画征录》就说：“傅青主画山水，皴擦不多，丘壑磊珂，以骨胜，墨竹也有气。”他的字画均渗透自己品格孤高和崇高的气节，流溢着爱国主义的气息，在中国古典书画艺术中，博得后人的高度赞赏。
    傅山在医学上，也有着巨大的成就。他内科、妇科、儿科、外科，科科均有很高的技术，而尤以妇科为最。其医著《傅氏女科》、《青囊秘诀》，至今流传于世，造福于人。傅山极重医德，对待病人不讲贫富，一视同仁，在相同情况下，则优先贫人。对于那些前来求医的阔佬或名声不好的官吏，则婉词谢绝。对此他解释为：“好人害好病，自有好医与好药，高爽者不能治；胡人害胡病，自有胡医与胡药，正经者不能治。”

傅山一生在政治和社会舞台上,与同仁“以道义相期许”,青年时期就为昭雪山西提学袁继咸冤案赴京请愿,成为名震京师的“山石义士”,进入中年以后,又为民族大义奔波不息,着意拼搏。入狱一年,坚贞不屈,谱写了可歌可泣的人生篇章。在思想文化方面,他博览经史诸子,参研佛道经典,开创诸子学,精通晋韵学和名学（逻辑学），擅长金石之学,博览群书,时称“学海”,与顾炎武,黄宗羲等人被后人推崇为“清初六大家”。而且他在反对以道统自居的理学说教、冲破儒家传统思想束傅方面,更具有启蒙意义、战斗精神和独创性。因此,傅山被认为是“十七世纪中国思想文化界的一座奇峰”、明清二朝三晋文化第一人，是一位少有的全才。他在社会科学,自然科学特别是医学和文学艺术的广泛领域中都取得了非凡的成就。有《霜红龛集》、《傅青主女科》、《男科杂记》等著作传世，故乡窦大夫祠有傅山的“虹巢”书斋，土堂大佛寺南侧土窑洞为傅山隐居处，崛围山南山松林中有傅山亲手构建的“青羊庵”，傅山被后世崇为神人，并有“诗不如字，字不如画，画不如医，医不如人”的独到评价。
    傅山作为封建社会中的知识分子，一生中处处表现了坚韧不拔的战斗精神。他那种“富贵不能淫，贫贱不能移，威武不能屈”的品格和气节，毫不愧对“志士仁人”的评价。然而，由于时代的局限和正统思想的作梗，他的爱国主义思想夹杂着浓厚的封建正统思想；他的民族主义思想无不打着大汉族主义的烙印，这些则应引起当今学者和研究者的注视。
    康熙二十三年（1684年）初，傅山的爱子傅眉忽逝，年愈古稀进入风烛残年的傅山悲痛异常，再也经受不得如此打击，不久则撒手人寰，与世长辞，时年77岁。