关于关联分析时标记条带的处理
(2010-04-13 16:55:45)
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杂谈 |
以下是扬州大学一研究生询问共显性标记条带处理时,我的答复!
您好,再重复一下处理带型时的步骤:
第一,应该首先确定引物在你检测的群体中一共有多少互 异的条带:即有多少不同的等位变异,如果你是人工读带,就是在不 同泳道上一共有多少不同迁移距离的条带。如下图所示三个材料:
1 2 3
-
- - - 即共有4种带型,分别赋值为:1,2,3,4 第二:由上,三份材料的在TASSEL软件中的基因 型数据分别表示为: 1:1;2:2;和3:4,这样的数据格式 软件就可以识别了,当然这里最好是知道每条条带的分子量大小,假 设这四种条带的分子量分别是133, 136, 139, 14 2(bp)则这三份材料的基因型数据可分别表示为:133:1 33,136:136;和139:142,TASSEL识别上述 两种格式的数据,具体数据格式的要求可参考附件中的标准数据格式 及TASSEL-help第11页相关内容。 希望上述内容对您有所帮助,如不清楚可电话联系我
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