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NCBI在线查找基因序列及其上下游1000bp序列

(2011-11-01 09:47:51)
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基因

上下游

NCBI

杂谈

分类: 生物信息资源

最近研究6个疾病基因,需要在NCBI下载基因序列及其上下游1000bp序列,经朋友推荐,方法如下:

以基因BRAF为例

第一步:在NCBI的gene中输入BRAF(human)如下:

http://www.ncbi.nlm.nih.gov/gene/673

第二步:点击右上方Genomic regions, transcripts, and products,如图:

NCBI在线查找基因序列及其上下游1000bp序列

 
出现以下页面:
NCBI在线查找基因序列及其上下游1000bp序列

 
点击:Go to reference sequence details,出现一下页面:
NCBI在线查找基因序列及其上下游1000bp序列

 
选择Reference GRCh37.p5 Primary Assembly(推荐使用),在Download GenBank, FASTA, Sequence Viewer (Graphics)中点击GenBank,如图所示:
 
NCBI在线查找基因序列及其上下游1000bp序列

 
选择右上方的Change region shown,Selected region,对起始和终止位置加减即可达到选择上下游区域的目的
 

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