再后是寺内的主体建筑大雄宝殿，为1913年所建，庄重雄伟。正中“大雄宝殿”三大字为清末名书法家黄云鹄所书。大殿的门窗壁板上雕刻着富有中国古典风味的花卉图案，精美别致，与“壮严引源”、“见道根源”的匾额和堂柱上各式对联相辉映，益发典雅华丽。 大殿正中供奉释迦牟尼、文殊和普贤三尊佛像，每尊都高达4米，系香樟木精雕而成，全身贴金，衣纹潇洒自如，神态慈祥肃穆，具有唐代塑像风格。殿外左右分立着八角双檐的钟亭和鼓亭。钟楼内悬钟为明代永乐年问所铸。殿左的厢房现辟为文物陈列室，展出自汉朝至清朝各种文物近干件。

大雄宝殿后为如来殿，为清末同治年间重修，双层结构，上层为藏经，藏有《频伽藏经》、《日本续藏经》各一部，约万余卷。殿前两个撑枋上，雕有凌云、乌尤两山的全貌，玲珑剔透、巨细尽致。殿正中供五尊如来像，代表着东、南、西、北、中五个方位，又称五方五佛，分别为阿閦佛、宝生佛、弥陀佛、成就佛和毗卢遮那佛。两旁为二十四尊护法天神木雕像和十八罗汉泥塑像，表情动作风趣幽默。

如来殿右侧西廊尽头为观音殿，重建于1925年。

乌尤菩萨像建于唐代，是乌尤山最早的佛教造像，系用青铜整体浇铸，高两米，重约三千公斤，造型古朴，威严生动，纯属印度造像风格。据佛典记载：面然为观世音菩萨化身相，相传观世音菩萨至此见两河沙岸，鬼魅啾啾，乃变面然像，为观音七十二化身，貌甚奇古，近似鬼王，以镇妖蜮。此山此寺以乌尤命名，即源于此。面然大士像原置罗汉堂中，世代迁流，铜像毁坏，弃诸草莽，幸得寺院住持遍能大和尚掩藏保护，后又蒙善信出资，修复面然大士像，使乌尤镇寺宝像，得以复现于世。我国汉传佛教寺院均无此类造像，而以面然大士为镇寺之宝，并以寺名之，实属鲜见。

如来殿左侧东廊尽头是方丈室。方丈室为一四合小院，幽静雅致。四壁嵌有不少匾联题词，其中宋代名士张方的诗，写出了乌尤山的气势：竹桥沙水乌尤渡，绝壁孤崖意气骄。 故与凌云分半坐，僧窗假寐见金蕉。在如来殿西侧有著名的尔雅台，传为汉代郭舍人注释《尔雅》的地方。台右侧临江绝壁处有明朝鼓汝实所书“中流砥柱”四个大字，字径达5米。为乌尤一景。旁有旷怡亭，是旷览江山胜迹、怡悦心志的好地方。再上为山顶花园，登园中八角亭远眺，峨眉苍郁的山峦，岷江滔滔的流水，辽阔的原野，三江环绕的乐山市，皆一一收入眼底，真可谓“江山这边独好”。