中医药博物馆坐落在中日友好医院南，北三环北侧的北京中医药大学内，1990年9月建馆，展出面积1500平米，是一座收藏丰富、内容系统的专业性博物馆。

博物馆坐北朝南共四层，一、二层为办公区和学术交流区，三四层为展览区，每周一、三、五、六日8:30-16:30 免费对公众开放。

三楼为“综合展厅”，包括“中药综合展区”和“药用动物展区”二大部分。展品主要以各类中药标本为主。陈列常用中药600种、1500多份中药标本；另有药用动物剥制与药用植物浸制标本近300种及百幅药用植物彩色照片。
药用动物展区

中药综合展区

中药综合展区，中草药标本

医学史料展

四楼为“中国医学史展厅”，展览以中华文化为大背景，同时以中国医药发展史为主线，通过各个时期的医药文物，再现了包括少数民族医学在内的祖国医学的主要成就。医史部分收藏历代医药文物1000余件，善本医籍200余种。

张仲景像

石药碾

中医药综合展厅

针灸铜人

“千金要方”碑拓

善本医籍

老药铺

藏文四部医典

藏医器械

蒙医器械