加载中…靶基因预测及功能分析网站
(2015-11-25 13:57:22)| 分类： 软件技巧 |
靶基因预测及功能分析网站：Target scan：
http://www.targetscan.org/MiRanda：
http://www.microrna.org/microrna/home.doPicTar： http://pictar.mdc-berlin.de/Mir TarBase：
http://mirtarbase.mbc.nctu.edu.tw/index.htmlRNA22：
http://cbcsrv.watson.ibm.com/rna22.htmlPITA：
http://genie.weizmann.ac.il/pubs/mir07/mir07_data.htmlTarBase： http://microrna.gr/tarbase/RNAhybrid：
http://bibiserv.techfak.uni-bielefeld.de/rnahybrid/GO分析网站： http://geneontology.org/EGAN网站： http://akt.ucsf.edu/EGAN/
4.2.4 miRNA 靶基因预测为了解经过测序和芯片筛选出来差异miRNA的潜在分子功能，我们用靶基因预测软件对这些miRNA预测了他们的目的mRNA。预测的原则是，首先利用当前主流的8个预测软件（
Target scan、 MiRanda、 PicTar、 Mir TarBase、 RNA22、PITA、 TarBase、 RNAhybrid）分别预测，将预测的结果取交集，
8个软件中有3
第四章 泌乳期和非泌乳期奶牛乳腺组织 miRNA 表达差异谱分析及功能预测
47个软件预测到同一基因，就认为是该miRNA可能的靶向基因。
4.2.5 靶基因的 GO 分析根据靶基因预测结果，对这些基因进行 GO 富集，分析这些 miRNA 主要参与的生物学功能。
4.2.6 调控网络分析用EGAN软件，对分析得到的miRNA进行网络图谱构建，得到以Lactation为中心的网络图。
第四章 泌乳期和非泌乳期奶牛乳腺组织 miRNA 表达差异谱分析及功能预测
47个软件预测到同一基因，就认为是该miRNA可能的靶向基因。
4.2.5 靶基因的 GO 分析根据靶基因预测结果，对这些基因进行 GO 富集，分析这些 miRNA 主要参与的生物学功能。
4.2.6 调控网络分析用EGAN软件，对分析得到的miRNA进行网络图谱构建，得到以Lactation为中心的网络图。
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