天后宫经重修定名为“元君古庙”，后在抗日战争时被日军炸毁。

现存天后宫为1994年，国家政协副主席，著名实业家霍英东先生倡议并捐资重建南沙天后宫。天后宫紧临珠江出海口伶仃洋，坐落于大角山东南麓，在天后广场正中就是石雕天后圣像（高达 14.5 米），是为纪念海上女神林默而建，建筑特点是集北京故宫的风格和南京中山陵的气势于一体，其规模是现今世界同类建筑之最，被誉为“天下天后第一宫”，也是东南亚最大的妈祖庙。