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Excel逼格其实也很高:Graphpad Prism6快速做图

(2015-04-17 11:55:40)
标签:

graphpad

prism5

统计图

攻略

sci

分类: sci攒人品ing
用Graphpad Prism5快速做出8种符合SCI投稿要求的统计图    

(转自MedSci)您还在为做统计图头痛不已吗?还在一边抱怨excel怎么这么笨却又不想从零开始学习那些复杂的统计作图软件吗?有没有什么解决的办法呢?

GraphPad Prism 集生物统计、曲线拟合和科技绘图于一体,其所具有的功能均非常实用和精炼,包括了一些特色的功能,如ROC曲线分析、Bland-Altman分析等;曲线拟合功能是GraphPad Prism超越其他统计软体的制胜法宝,GraphPad Prism的线性/非线性拟合功能使用操作极其方便,不仅内置了常见的回归模型,还专门内置了Aadvanced Rradioligand Bbinding, Bacterial Growth, 剂量反映曲线,峰拟合等数十个生物统计模组,GraphPad Prism的绘图功能也很具特色,无需专门绘製统计图形,只要输入资料,图表自动生成且随资料改变及时更新,非常方便实用。能进行自定义方程曲线拟合的软体中,GraphPad Prism的操作最为简便快捷,拟合前参数设置方便,拟合速度快,并支援批量拟合,这在同类软体中非常少见,可以说GraphPad Prism当之无愧为非线性拟合的高手。

     小编发现GraphPad Prism不仅简单易学而且可以搞定大部分医学研究所需的统计与作图,所以今天总结了几种常用统计图的做法,教您轻松快速地做出漂亮的统计图,您只需花很少的时间看完这个教程就可以彻底摆脱excel笨拙的作图功能了。 废话不多说让我们正式开始。

1. 折线图 

折线图最为统计图中很常见的一类图,它的特点是可以显示随时间而变化的连续数据,因此每个数据点都有一个相应的X轴值和Y轴值,所以我们在用graphpad做折线图时在数据表类型的选择上一般选XY图(XY graphs)。如下文实例。 

1.1 根据Table1的1组原始数据(4个样本在4个时间点分别测得的OA值)做折线图

打开Graphpad prism 5软件,选择XY图(XY graphs),折线图图标,因为是原始数据,需要软件帮你计算均值和误差,因此你要告诉软件你的Y值的样本数是多少,这边的样本数是4,因此我们把样本数设为4,如下图
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在Data分栏中将数据粘贴进去,如下图
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在Data分栏中将数据粘贴进去,如下图
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软件就会自动帮你算出均值和误差值,并做好折线图,把字体和坐标轴方向改成你想要的格式后,如下图一幅漂亮的折线图就做好了,简单吧?
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1.2 根据Table2的原始数据(治疗组和对照组的4个样本在4个时间点分别测得的OA值)做折线图
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打开insert 菜单的New Data Table功能,加入一张新的数据表,见下图
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仍然选择XY图(XY graphs),告诉软件样本数是4
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在Data栏中输入数据
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软件已经自动帮你把图做好了,稍微美化后得下图
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1.3 用已经处理好的1组数据做折线图 

如果你的数据是用其他软件(excel,origin,etc..)已经处理过的,Graphpad prism也可以帮你完成剩下的作图工作,你只需告诉软件你输入的数据是已经计算好的就行了,比如你想用Table3的1组数据做折线图
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新建一个数据表,仍然选择XY图(XY graphs),告诉软件你输入的是计算好的值,见下图
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在data栏中粘贴数据,如下图
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打开Graphs栏目下的Data3,看到软件已经做好了图,稍微调整一下字体的大小,就可以得出下图所示的折线图了
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1.4 用已经处理好的2组数据做折线比较图

如果要用Table4所示的两组已经处理好的数据作图,步骤和1.3的一样。
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仍然选择XY图(XY graphs),告诉软件你输入的是计算好的值,见下图

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将数据粘贴进去
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软件即时生成的图如下图所示
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折线图的处理讲完了,简单吧,让我们来看看柱状图怎么做 

2. 柱状图 

柱状图可以很直观地表示出不同组别之间的数值差异,和折线图不同的一点是它的X轴对应的是组别而不是数值,因此在GraphPad分类栏的选择上也有所不同,见下文的实例 2.1根据Table 5的原始数据做柱状图

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选择Column graphs栏,因为该栏默认输入的都是原始数据,因此没有输入样本数的地方,只需选择数据处理类型为(Mean&SD), 如下图。
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在Data分栏中输入以下数据
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软件就会自动帮你算出均值和误差值,并做好柱状图,见下图
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2.2 根据Table6的原始数据做两组数据比较的柱状图
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这次因为涉及到两组数据比较,所以我们选择grouped栏,图表类型选择柱状图,因为Grouped栏并不是像Column graphs栏一样默认输入的是原始数据,因此有输入样本数的地方,这边的样本数是4,因此我们相应地设置样本为4,见下图。

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在Data分栏中输入以下数据
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软件会自动帮你做好一幅漂亮的分组柱状图,如下图。
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2.3 如果你的数据是已经处理过的数据也可以直接导入或拷贝到Graphpad

现在我们用Table7中的数据做一个柱状图
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仍然选择Grouped栏,告诉软件你输入的值是已经计算好的,如下图
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软件及时生成柱状图,如下图
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2.4 用两组计算好的数据做一个两组比较的柱状图 

用Table 8的数据做成两组比较的柱状图
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操作步骤和2.3一样,只需多输入一组数据,仍然选择Grouped栏,告诉软件你输入的值是已经计算好的,如下图
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在data栏中输入数据
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软件即时生成的图如下图

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折线图和柱状图的处理都讲完了,在graphpad数据表类型的选择上小编总结出了2条规律: 

一.折线图,散点图这种有一一对应的X,Y值一般都选择XY栏 
二.柱状图,箱型图这种有组别的数据需要用软件计算的选择column栏,处理加工过的数据一般选择group栏


3. 组合和导出图片 

点击layout栏,出现下图所示界面
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根据你的图片的数量,选择合适的布局,下图选择的是6张图分成3排排列
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将做好的图片拖到对应的方格中,用添加文章工具加入图片编号,完成后如下图所示
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然后导出图片 点击File目录下的Export,出现下图所示的界面,选择好符合相关SCI杂志要求的格式,分辨率和宽度,如下图

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点击ok,一张漂亮的可以直接拿去投稿的组合图就做好了,见下图
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是不是觉得很简单呀?你也赶快去试一试吧

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