中国兽医协会是按照国务院2005年15号文件的要求，由中国动物疫病预防控制中心、中国农业大学、中国兽医药品监察所、中国动物卫生与流行病学中心等4家单位为发起人，经过几年的筹备，于2009年10月28日正式成立的全国性、行业性、非营利性的社会组织。

中国兽医协会最高权利机构为全国会员代表大会，每5年召开一次，选举产生理事会。理事会选举协会会长、副会长、秘书长和常务理事。在全国会员代表大会和理事会闭会期间，常务理事会行使理事会的职权，执行全国会员代表大会的决议。协会下设分支机构和办事机构。分支机构包括专家工作委员会、职业道德与维权工作委员会、教育科技工作委员会等3个工作委员会和宠物诊疗分会、动物诊疗分会、动物防疫分会、驯养及实验动物分会、中兽医分会、动物卫生服务与福利分会等6个分会。办事机构设综合办公室、会员管理部、信息宣传部、联络交流部、继续教育部5个部门，由秘书长领导办事机构进行日常工作。