方法一：一步到位——点击mathtype里面的“RIght-numbered”即可自动添加公式及对应的右编号，不过默认是（1.1)形式的，如果要改为（1）形式的，可以再“Insert Number”按钮下，选择“format”，去掉“section number”前面的对号。此外，format中还有其他选项。

方法二：对于已经已经输入好的公式，如何插入编号。

  在欲编号的公式后边，点击“Insert equation number”(安装mathtype后，word里会有这个菜单按键的)，公式后面即有了编号。
    选中该编号，点击Insert Chapter/Section Break命令，更改章节号。
以后，在插入编号放在右边的公式时，公式就按照第一个公式设定的格式进行自动编号。
    如果，在正文中要用到公式编号时，将鼠标放在需要写编号的位置，点击Insert Equation Reference命令，然后双击要插入公式的后面的编号，则该公式编号就出现在鼠标位置。
    这样公式会自动按顺序编号，公式编号修改后，正文里的编号也随之自动修改，方便且不出错。    
    注意，在正文中间删除或添加公式后，需要点击update Equation Numbers命令进行公式编号更新。
 若要调整自动编号的格式，点击“Format”

另，小心得：如若在文中多次用到(3-1)这个公式，那么复制粘贴刚刚产生的这个(3-1)即可，update也不会再出错了。