光合作用总反应式中，反应物有12个H₂O，产物中有6个H₂O。消耗的12个H₂O去向很明确，形成了6个O₂，以及还原氢。但形成的6个H₂O来自哪里，什么过程中产生的，很多老师及学生都不明白。教材中讲光合作用过程时也没讲解过水是如何生成的，但总反应式中偏偏就有。那么产物中的水到底怎么形成的呢？

简单说就是碳反应过程中，ATP水解成ADP+Pi供能时并没有直接消耗水，而是消耗了C₃中的H⁺和HO^-，ADP+Pi形成ATP时再把所得的H⁺和HO^-转化成了H₂O。以前的参考资料就直接说碳反应过程中生成了水，但仔细阅读过植物生理的老师就极力反对这种说法。问题就在于ATP的形成和水解过程中水分子的形成和消耗教材里也没有讲到，搞得光合作用过程中元素没办法守恒，只好说碳反应过程中产生了水。

我们不妨来看光合作用的过程。碳反应的总反应式可以这样写：

6CO₂+18ATP+12NADH+12H⁺+12H₂O→C₆H₁₂O₆+18ADP+18Pi+12NADP⁺

可见碳反应不仅没有产生水，反而消耗了水。

光反应总反应式则可这样写：

 12H₂O+12NADP⁺→6O₂+12NADPH+12H⁺

18ADP+18Pi→18ATP(+18H₂O（注意括号中的水）

本来ATP水解是需要消耗水的，18个ATP水解，也就要消耗18个H₂O。但在碳反应中，ATP水解供能时并没有消耗H₂O 。其H⁺与HO^-都来自三碳化合物，而ATP的形成是要形成H₂O的，不过一般反应式也把产物中的H₂O省略了，这样就有问题了，ATP水解时得到了三碳化合物中的H⁺与HO^-，合成时形成水又省略了，相当于三碳化合物中H⁺与HO^-白白不见了。所以以前参考资料为了简化就说碳反应过程形成了水，但这显然不符合事实，现在则干脆不讲了。对于学生来说，要理解这个问题相当有难度，避而不讲也不失为一个好办法。

总结一下，碳反应过程中三碳化合物在还原过程中所脱去的H⁺与HO^-被ADP+Pi得到，然后在光反应过程中缩合形成了H₂O。光反应中水的光解消耗12个H₂O，碳反应中也总共消耗12个H₂O，形成18个ATP产生18个H₂O，ATP水解供能不消耗水，相当于净消耗6分子水。