首先，人類的 Y 染色體“不斷衰減”就不是個事實，因爲有修復機制。（之所以這個謬論被傳得這麼火，我懷疑是和部分女權主義人士有關。）此外，就算 Y 染色體徹底衰減掉，也是有辦法有雄性的。

Y 染色體本身結構非常複雜，​全長約 60 Mbp，除掉兩端共約 2.5 Mbp 的和 X 染色體連鎖的僞常染色體區段（pseudoautosome）以外，即非重組區（non-recombining region），其中一大半是高度重複的異染色體質（heterochromatin），​​其餘一半眞染色質（euchromatin）部分的近半區域也都是 2、3、4、6次之類的重複片段，在整個 Y 染色體中只出現一次的片段只有 10 Mbp 左右。Y 染色體上的基因很少，在 100 這個數量級上，準確數量不太容易算，有一些假基因，因爲生存必要的基因不能只在 Y 染色體上，否則女性沒法活了。Y 上眞正有用的都是一些和男性特徵發育、繁殖相關的基因。

​http://s2/mw690/001hTuQNzy7afAtnOpz51&690人類的Y染色體在不斷衰減？人類以後是不是要絕種了？" TITLE="人類學雜記——47. 人類的Y染色體在不斷衰減？人類以後是不是要絕種了？" />

以下一段參攷 Bachtrog (2013) «Y-chromosome evolution: emerging insights into processes of Y-chromosome degeneration» （https://www.nature.com/nrg/journal/v14/n2/box/nrg3366_BX1.html）：

​人的 Y 染色體非重組區的眞染色質又包含了 X-退化區（X-degenerate）、X-轉位區（X-transposed）、迴文序列區（ampliconic）等幾類。

從人和其它哺乳類的 Y 染色體比較來看，X-退化區是 Y 染色體中最古老的，是從 X 染色體逐漸退化縮小形成的，目前只有 16 個活躍的單拷貝基因（包括性別決定基因 SRY），但這些基因相當保守，都是從人和獼猴的共同祖先繼承下來的，但黑猩猩丟了 4 個。（所以以黑猩猩這種 Y 染色體演化這麼快的物種，過了六百多万年最有用的部分也還在，沒有影響其繁殖）。

迴文區的片段都是 2 到多拷貝的，基因數量最多，有幾十個，很多是睾丸發育相關的。這些在黑猩猩也不太穩定，也丟了幾個基因。如果這些壞了的話，只要能從 Y 染色上另外的同源片段轉化修復就好了。

而 X-轉位區是大約三四百万年前（也就是在六百多万年前人和黑猩猩已經分開之後）從 X 染色體上又複製一份 3.4 Mbp 的區域接入 Y 染色體上的，也就是說這個區域黑猩猩和其它靈長類的 Y 染色體上都沒有。可以想象，經過一段時閒這個區域逐漸退化，假基因也會逐漸丟掉。

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重構的人的 Y 染色體演化史，來自 Bellott DW (2014) «Mammalian Y chromosomes retain widely expressed dosage-sensitive regulators»

而人的 Y 染色體因爲沒有減數分裂時同源重組的壓力，變化的空閒非常大，只要沒把最重要的決定男性的基因丟掉，還能傳宗接代，就沒問題。經常是一整段幾 Mbp 區域直接丟掉都不影響。比如 C2b1c1-F3918 這一支，即傳統上說的 448del 這支，還有整個的 N-M231，都發生過整段 Y 染色體丟失的事件，但仍然人丁興旺。還有人類的 AMELY 基因在 X-退化區，這個基因在 H 和 J 單倍羣下的一些支系丟失了，但也沒有影響他們成爲男性及繁衍，只是因爲這個基因上有法醫標準中用於判斷男性的位點，這些支系的人的樣本因此可能被誤判爲是女性的（Jobling MA (2007) Structural variation on the short arm of the human Y chromosome: recurrent multigene deletions encompassing Amelogenin Y）。

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Y 染色體各單倍羣一些代表的結構變異，包括一些片段缺失的、重複的、顚倒的、異染色質長度變化的等等。來自 Repping S (2006) «High mutation rates have driven extensive structural polymorphism among human Y chromosomes»

也就是說 Y 染色體會退化，但至少存在兩種修復/恢復的機制：從 Y 染色體上同源的區域複製/轉化；從其它染色體（最多見的是從 X）複製一段接到 Y 上。畢竟只要一個 Y 染色體失掉了必要的功能，他這一支就沒了，而同時代還有成千上万功能完好的 Y 染色體會留下後代。別忘了，按照達爾文演化理論（evolution 既不是進化也不是退化，是沒有方向的），適應的、能留下後代的生物就能繁衍下去，而不是朝着一個確定的設計好的方向發展的。

​另外，即使 Y 染色體徹底退化掉，也是依舊可以有雄性的。有兩種裔鼠（Tokudaia），雌性是兩條 X 染色體（XX），雄性只有一條 X 染色體而沒有 Y 染色體（XO），但仍有其它機制保證產生雄性。