肠炎的治疗包括一般治疗、药物治疗，纠正水与电解质紊乱和良好的护理。
　　一般治疗：适当地进清淡饮食，使消化道适当休息，注意休息，用具消毒，防止交叉感染。
　　药物治疗：包括控制肠道内外感染和胃肠粘膜保护剂，微生态制剂治疗。如果是肠道内外感染引起的肠炎，尤其是粘液脓血便时可适当使用抗生素控制感染，要根据不同的细菌感染选用不同的抗生素，成人可选用新霉素、庆大霉素、氟哌酸、氨苄青霉素，甚至头胞类抗生素。但儿童就不宜选用新霉素、庆大霉素、氟哌酸等抗生素。胃肠粘膜保护剂主要有思密达、必奇，可保护胃肠粘膜，凝固杀死肠道的细菌与病毒，起到止泻作用。微生态制剂，如妈咪爱、常乐康、金双歧、整肠生等，主要是调节肠道菌群抑制肠道有害细菌生长，达到止泻作用。
　　纠正脱水和电解质紊乱：在出现腹泻初期，在家里可用米汤加少许糖盐或开水加糖进行口服防脱水，对于轻度、中度脱水，但一般没有呕吐及腹胀的病人可以只口服补液盐。在口服ORS补液盐时特别要注意，每袋补液要一次加500ml温开水冲服，24小时未服完时一定要倒掉，重新配制。一般按轻度脱水总量100—120ml／kg，中度脱水120—150ml／kg体重补给。如果是重度脱水或轻、中度脱水患者出现一般情况很差时，甚至有钾、钠、氯电解质紊乱酸中毒时，就需要在医院进行静脉输液治疗。
　　护理：对于老人、儿童和婴幼儿腹泻的护理是非常重要的，包括做好胃肠道隔离，急性期准确记录出入水量，保持口腔皮肤清洁，每次大便后用温水冲洗臀部，防止尿布疹及继发感染，肛周发红糜烂时可用20％鞣酸软膏涂局部皮肤，输液时要求按速度与量进行，四肢发凉时要注意保暖，注意病室空气流通。恢复期重视营养，饮食中要逐渐增加易消化食物，保持环境清洁，避免继发其他感染。
2岁以下小儿，在秋冬季出现流行性腹泻，粪便蛋花样或白色水样便，无脓血大便的，患轮状病毒肠炎的可能性大；如发生于夏季，大肠杆菌致病的可能性大；粪便含粘液、脓血的应考虑细菌性痢疾、空肠弯曲菌或鼠伤寒沙门氏菌肠炎。

(1)轻型腹泻的，要禁食不易消化的食物和高脂肪饮食，暂饮米汤、豆浆、酸乳或脱脂乳，母乳喂养者要缩短喂乳时间。重型腹泻的患儿要速送医院救治。在家中治疗的轻型腹泻，可口服补液盐(药铺中有售)，每包冲水500毫升，少量多次喂服，一般轻度脱水的，每日每千克体重50毫升；中度脱水的，每日每千克体重80—100毫升。吐泻好转后3—4天再逐渐恢复正常饮食。

(2)小儿得肠炎，有条件时最好要做大便化验或培养以明确诊断。大肠杆菌肠炎时，可用多粘菌素B，每日每千克体重5—10万单位，3—4次分服；或用卡那霉素，每日每千克体重50毫克，分3—4次口服。疗程不要超过7天，以防菌群失调。

(3)空肠弯曲菌肠炎可用琥乙红霉素，每日每千克体重30~50毫克，分3~4次ngR。

(4)霉菌性肠炎可用克霉唑，每日每千克体重20—60毫克，分3次口服。

(5)病毒性肠炎，抗生素治疗无效，可用中成药卓丹止泻灵，1—3岁每次5毫升，每日3次；3—7岁，每次10毫升，每日3次效佳。