- 幼犬出生时携带的蓝色眼睛会在大约6-8周的时候逐渐变深至棕色。有时候其中的一只会保持蓝色, 但这个情况可以在幼犬2周大的时候识别出来。咖啡色和蓝色的边境牧羊犬具有的是淡棕色或琥珀色的眼睛。
b)眼睛的标准
- 相对比较分开在两边, 椭圆形,大小适中,色调与毛色协调,传递情感。
- 没有明确规定的失格。
c)颜色
- 同鼻子色素一样,眼睛颜色受到相关基因的影响,因此身上的主要毛色会在眼睛颜色上得到体现。黑的,三色的和大部分红色的边境牧羊犬偏向于深棕色的眼睛。巧克力色和蓝色的边境牧羊犬,不太可能会遗传深色的眼睛,所以正确的会是淡色或者琥珀色的。
- 根据早期在边境牧羊犬中发现角膜白斑(散开性斜视 即浅蓝色眼睛)的情况,边境牧羊犬出现蓝眼 (另一只是棕色)是很普通的。尽管眼睛有角膜白斑的狗在工作中并没有出现任何问题,他们是不允许参加showring的。
- 在繁殖已知角膜白斑携带者的时候要格外注意,因为这是一个具有遗传性的特征。

d)眼神传递情感
- 狗的眼睛可以看出狗是否警觉,敏锐,对周边环境感兴趣和有好的天性与智慧。 因此,边境牧羊犬的眼睛永远都不应该出现“茫然,呆滞”的神情。
- 眼睛如果出现凸出或者太小或者外形成圆形,会让狗看上去外观有点像狐狸。
- 边境牧羊犬的眼神所表达出来的感情应该是很温柔,极具智慧的;生硬的眼神是不值得提倡的。
e)尽管没有明确规定的失格,但现在有个趋势是有些边境牧羊犬的眼睛表现为凸起(凸出),这是应该避免的。

f)蓝眼
- 根据大部分繁殖者的经验来看,两只正常的棕色眼睛的边境牧羊犬生的幼犬也会出现一只蓝眼(很少两只眼睛都是蓝眼)。
- 通常会表现为,头上出现过多白色。例如,一半是白色的脸,以及蓝眼(因为眼睑缺少色素),而其他地方和另一只眼的眼睑的色素正常。
- 通常来说,一胎平均7只的话,只有一只会受影响。
- 2只已知携带者繁殖的话,会增加30%小狗受影响的概率。
- 决定蓝眼的基因还不明确,但是很大可能是因为眼睛的色素量低。这个与决定身上白色花色基本一致。
- 还有一个解释就是,蓝眼可能会链接着体现陨石色毛色的基因。
- 另外,角膜白斑(散开性斜视 即浅蓝色眼睛)和正常的幼犬的蓝眼睛是很容易区分的。正常的幼犬蓝眼睛会在大约8周大的时候根据毛色而慢慢变深。
