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电泳出现拖尾现象

(2008-04-15 22:53:54)
标签:

杂谈

 电泳出现拖尾现象,英文成为smear,就是弥散。其原因,主要从以下两个方面考虑:
 

1、PCR产物自身原因:

往往由于酶量过多或酶的质量差,dNTP浓度过高,Mg2+浓度过高,退火温度过低,循环次数过多,而造成PCR的非特异性产物过多。

对策:①减少Taq酶的量,或调换另一来源的酶。②减少dNTP的浓度。③适当降低Mg2+浓度。④增加模板量,减少引物的用量,减少循环次数,提高退火温度。

2、电泳体系的问题:

(1)电泳缓冲液TAE或者TBE的污染,建议更换缓冲液。(2)上样时样品漂了,建议增加上样缓冲液的用量,以及小心加样。(3)电压太高。(4)适当把你的胶的浓度加大。(根据你的片断大小而定)(5)观察你的marker是否也存在拖尾现象,作为对照。

 

PCR拖尾及假阳性的原因及对策

拖尾

  现象:产物在凝胶上呈Smear状态。

  原因:

  1.模板不纯

  2.Buffer不合适

  3.退火温度偏低

  4.酶量过多

  5.dNTP、Mg2+浓度偏高

  6.循环次数过多

  对策:

  1.纯化模板

  2.更换Buffer

  3.适当提高退火温度

  4.适量用酶

  5.适当降低dNTP和镁离子的浓度

  6.减少循环次数

  

  假阳性

  现象:空白对照出现目的扩增产物

  原因:

  靶序列或扩增产物

  的交*污染

  对策:

  1.操作时应小心轻柔,防止将靶序列吸入加样枪内或溅出离心管外;

  2.除酶及不能耐高温的物质外,所有试剂或器材均应高压消毒。所用离心管

  及加样枪头等均应一次性使用。

  3.各种试剂最好先进行分装,然后低温贮存

 

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