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遗传学之八----近亲繁殖系数的简单计算

(2010-06-25 07:12:12)
标签:

近亲繁殖

遗传学

系数

猫猫

杂谈

分类: 猫狗养护

虽然有电脑程式可以应用,只需将照血统书的名字输入数据库,便可以自动计算近亲繁殖系数,但是如果血统书的近亲繁殖比较简单的时候,人手计算也是非常方便。现在简短的介绍如何利用路径系数path coefficient方法计算近亲繁殖系数。

路径系数方法

首先绘画一个“箭头血统书”,在这一个图中每一个体都只出现一次。箭头从父母指向后代,箭头只可以向下或对角向下。

例1

 

http://s16/middle/4450c4a8t89d0925ac8bf&690


例1:原本的血统书和箭头血统书。

在箭头血统书中,我们找出所有从父母中的一只指向另一只后代,而中间经过其他的猫,而个别的猫不能在路径中出现超过一次。每一条路径,我们计算有多少猫涉及的数目。每一条路径对近亲繁殖系数的影响是1/2再以路径中出现的个体数目为次方。

从例1的箭头血统书,我们从每一只父母得出两条路径到达其他的猫:

CAD -> (1/2)³ = 1 / (2 x 2 x 2) = 1/8
CBD -> (1/2)³ = 1 / (2 x 2 x 2) = 1/8

近亲繁殖= 1/8 + 1/8 = 1/4 = 0.25 = 25%


如果有共同祖先,即:路径折转并再重新向下,我们要考虑是同系繁殖。(在以上的例子中,两条路径的共同祖先,分别是A和B都被画上了下划线。)利用路径系数方法计算同系繁殖共同祖先的近亲繁殖系数。 1加共同祖先乘以近亲繁殖系数,再次方在路径上涉及的猫的数目。

因此,如果在这一条路径上出现的个体猫的总数为n,而近亲繁殖系数的共同祖先是F,涉及近亲繁殖系数将会是(1/2)^nx (1+F)。

所有路径的涉及近亲繁殖系数的总和便是近亲繁殖系数。


例2

http://s6/middle/4450c4a8t89d096184ad5&690


例2:原本的血统书和箭头血统书。

现有的路径是:BDC、 BDFEC、 BEFDC、 BDEC、 B EDC、 BEC。

共同祖先是D是近交,而他的箭头血统书将会是如此:

http://s10/middle/4450c4a8t89d0980ee689&690


D的箭头血统书

D的近亲繁殖是(1/2)² = 1/4。

每一条路径的涉及近亲繁殖系数将会是:

Path n F (1/2)^n x (1+F) total
BDC 3 1/4 (1/2)³ x (1+1/4) = 1/8 x 5/4 = 5/32 = 0.15625
BDFEC 5 0 (1/2)^5 x (1+0) = 1/32 = 0.03125
BEFDC 5 0 (1/2)^5 x (1+0) = 1/32 = 0.03125
BDEC 4 0 (1/2)^4 x (1+0) = 1/16 = 0.0625
BEDC 4 0 (1/2)^4 x (1+0) = 1/16 = 0.0625
BEC 3 0 (1/2)³ x (1+0) = 1/8 = 0.125

近亲繁殖=涉及总和= 0.46875 = 46.875%

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