陈文龙为南宋末年名臣、儒将，是与文天祥齐名的抗元民族英雄。宋咸淳四年(1268年)状元，宋度宗御笔改其名为“文龙”，字“君贲”。曾官居参知政事(相当于副宰相)等职。他居官廉正，刚正不阿，关心民瘼。在南宋末年国家即将覆亡之际，与文天祥等竭力拯救危亡，最后固守兴化城，兵败被俘。被元军押送北上，途经临安(今杭州)绝食而死，葬于杭州西湖边北山葛岭南坡，诏谥忠肃，后人把他与同葬于西湖的岳飞、于谦，合称“西湖三忠肃”。陈文龙后被尊为神灵，敕封为水部尚书、镇海王等，成为民众心目中的“水上保护神”。

　明洪武元年(1368年)，明太祖朱元璋命中书省派员到全国各地访求应祀神祇。“凡有功于国家及惠爱在民者著于祀典，令有司岁时致祭”。在定各地城隍庙祀典的名单中，有庐陵的文天祥、福州的陈文龙等。阳岐尚书祖庙就是在这时期始建的。为纪念莆田籍抗元英烈陈文龙，祈佑生意兴隆，平安往返，福建客商们就在兴化道建一小庙宇，奉祀陈文龙和同为莆田籍的妈祖娘娘。这就是陈文龙尚书庙在福州的最早起源，陈文龙进入了福建民间信仰的神祗行列，成为一个十分独特的地方民俗文化现象。在以后从此分炉出三四十座尚书庙，连绵不断分布在海峡两岸沿江沿海，成为维系闽台民众之间同胞情谊的重要神缘。