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连接数L=T+W

(2007-03-25 20:51:06)

拓扑异构酶

  溴乙锭

  负超螺旋                松驰DNA            正超螺旋

 

  DNA分子结构的上述变化可以用一数学公式来表述。

L=T+W

  其中L为DNA的连接数(linking number),它是DNA的一条链与另一条链交叉的次数,是一个整数,它反映的是环型双螺旋DNA分子的拓扑特性。在不发生链的断裂时,L值是一个常量。T为DNA分子双螺旋的螺旋周数(twisting number),对于B-DNA而言,T=N/10,N指DNA分子所含碱基对的数目。W为DNA分子的超螺旋数,即双螺旋轴的扭转周数,负超螺旋的W为负值,正超螺旋的W为正值。

  例如,某一B-DNA共有450个碱基对,不存在超螺旋时,L和T都是45,这时W=0。现在若将DNA分子的一端固定,另一端朝双螺旋相反方向旋转5圈后使两端封闭,此时L为40,分子的张力可以按两种方式分布,一种在分子内保留一个单链区,即T减为40,W仍然为0。另一种方式是T维持原来的45,L仍为40,为了满足上述方程,W就成为-5,即该DNA分子成为超盘绕5次的负超螺旋。可见双螺旋DNA的松开导致形成负超螺旋;相反双螺旋DNA的拧紧则导致形成正超螺旋。

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