核磁共振检查无X 线的辐射效应，因此对人体没有明显损害，且图像层次清楚，分辨率高。其缺点，一是检查费用高；二是安装心脏起搏器的病人不宜使用；三是成像时间长，危重病人很难接受长达40 分钟的头部扫描，因此，核磁共振检查对于急性中风病人并非首选的检查项目。

    由于技术原理的不同，CT 和核磁共振对不同性质的病灶敏感度不同，在具体应用时也有着一定的差异。CT 对出血性脑血管病诊断较敏感，而且较省时省钱，尤其是对意识障碍者更为适用。核磁共振对诊断缺血性脑血管病较敏感，不仅发现病灶早，而且对小梗死灶，尤其对脑干和小脑梗死灶的诊断，是CT 不能替代的。核磁共振和CT 比较还有如下优点：核磁共振检查对梗死区水肿的改变较敏感，故可较早地显示梗死灶。一般在发病后1 一2 小时，做核磁共振检查，就可显示信号较强的病变特征。而CT 却往往需等24 小时才能显影，过早检查常为阴性。核磁共振对腔隙性脑梗死显示优于CT 。CT 只能进行横断面扫描，而核磁共振还能从矢状面、冠状面上探查，所以，对于10 毫米以下的腔隙性脑梗死CT 往往无能为力，而核磁共振对直径2 毫米以上的病灶即可显示。 cT 难以显示后颅窝，尤其是脑干病变，而核磁共振对检查后颅窝的脑梗死具有重要意义，正好填补了CT 的不足。对脑出血伴梗死的病灶，核磁共振比CT 灵敏度高。在脑出血的亚急性期，CT 呈现等密度或低密度影，诊断困难；而核磁共振可显示血肿特征性形态。

    对于脑动脉瘤和血管畸形，核磁共振诊断价值高于CT 。CT 需要靠注射造影剂方能显示，而核磁共振不需要注射药物就能清楚地显示病变的部位和范围，这给显影剂过敏者带来了极大的方便。另外，CT 是利用X 线成像，对人体有一定损伤；核磁共振是利用电磁场成像，对人体不产生不良影响，但是检查时间较长，价格较贵，有些地区没有普及。因此，具体选用CT 还是核磁共振检查，要根据具体情况和医生对病清的综合判断而决定。