赤山湖的野生鸟类有15目52科128属199种，包括东方白鹳、中华秋沙鸭和青头潜鸭、白枕鹳4种国家一级重点保护野生动物+小天鹅、白琵鹭、苍鹭、长耳鸮、鹊鹞等39种国家二级重点保护野生动物，以及百余种国家“三有”保护动物。

鸟类是广泛的生物多样性状况和趋势的最准确表征之一，是反映生态环境的“晴雨表”。赤山湖的变迁，直接影响鸟类的生态环境和自身生长。2007年开始，这里先后关停、搬迁了多家化工污染企业，解除了6000亩精养鱼塘养殖合同，并通过退渔还湖、退渔还湿，完成了1万多亩湿地的修复与恢复，相继实施河道治理、堤防加固、闸站建设等工程，恢复花兰墩、白水荡两大湿地。

赤山湖管委会通过保护野生鸟类和它们的生存环境，很好地保护了当地的生物多样性。赤山湖湿地形成了“湖面广阔、河流环绕、滩涂交织、岛屿点缀”的自然风貌。

2017年，组建巡查队-对全园及外围保护区域湿地资源与水环境进行巡查保护。2019年，建成生态环境监测监控系统与水质实验室，实现对园内水质、水文、气象、空气质量、生物物种生存状态的实时监测，为保护湿地资源提供必要的技术支撑。

2021年，依法依规对公园保育区、生态恢复区等区域实行部分封闭管理，减少人类活动对湿地动植物的影响，形成湿地资源“保护网”，为生物多样性提供了优越的生存空间。

科技人员环湖一圈，统计鸟类种类数量、出现区域生存状况，拍摄鸟类活动影像，辨别记录新物种......以及保护和修复湿地为700余种物种提供生存、繁衍场所......

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