宝珠洞位于翠微山顶，建于清乾隆四十六年（1780年）。去宝珠洞的路上先要经过建于清代的关帝庙（供奉关公），然后路过乾隆御笔“欢喜地”、“坚固林”的牌楼（从进入牌楼开始，就算进入七处了），还要路过御制诗亭，亭内是一大巨石，上刻清乾隆十三年（1748年）乾隆游宝珠洞时写的三首七言绝句，才到宝珠洞的山门。

进入山门后是一个四合院，正殿是个二层阁楼，一层是观音殿，匾额“诸法正观”，供奉观音菩萨，二层是阿弥陀佛殿，供奉三世佛（释迦牟尼佛，药师佛和阿弥陀佛）。正殿对面是眺望轩，是个敞亭，可以远眺山下美景。正殿有两个配殿，一个是佛海缘（商店），一个未开放。

观音殿西有个横额“宝珠洞”的小门，宝珠洞藏在观音殿后墙的一堵由砾石组成的山石里。山石与观音殿之间的小路只有1米多宽，山石正中有个岩洞便是宝珠洞，洞内供奉鬼王菩萨像，传说清康熙年间，桂芳海岫和尚曾在洞中梵修多年，能诵经驱鬼，俗称“鬼王菩萨”，像前置一牌位，上书“钦命赐紫圣感堂中兴第一代传临济正宗三十三世桂芳岫翁老和尚位”。传说，宝珠洞是桂芳海岫在六处香界寺当住持时每天用手指把一块一块砾石抠出来的而形成的。

从宝珠洞出来，是观音殿东侧，有一石刻“阿弥陀佛殿”的石阶路，可登上到二层的阿弥陀佛殿，阿弥陀佛殿建在宝珠洞的正上方。