三官庙南配殿供奉的是道教中的福星与寿星，福星天官主管祸福，南极仙翁主管生死。北偏殿供奉着东岳大帝黄飞虎,南斗居士云中子，他们是道教中主管人间吉凶福祸的神灵。

海上丝绸之路博物馆占地面积7200平方米，在三官庙北面不远处，由古船博物馆改建而成。

博物馆展出了蓬莱小海出土的4条元明时期古船及随船出土的大量文物。这些古船见证了蓬莱作为海上丝绸之路的一个重要港口，以及昔日的繁荣与兴盛。

在博物馆的一层，还展出了随古船一起出土的铁锚、缆绳、货币、陶瓷器等大量文物，这对研究中国古代航海史、造船史都具有重大的意义。

博物馆展示区分五个部分:昔日回眸——古登州港、船业史话——中国古代造船史、瑰宝再现——出土古船、动感影院——多媒体演示和身临其境——户外体验区。

    博物馆还运用了雕塑、壁画、模型等多种艺术手段，用光、电、多媒体的影像营造活的历史，突出了“登州古港”和“蓬莱古船”两大主题。