中山舰博物馆坐落在金鸡湖的西南角，舰馆合一的主体形象有较强的视觉冲击。一万一千平米的主体建筑由相连的舰体陈列馆和辅助陈列馆组成，舰体陈列馆运用“舰魂铸碑’的设计理念，外形如同杨帆出海的战舰。

中山舰1997年1月被成功打捞后，一直停放在修缮地湖北造船厂。2003年9月20日单位组织去参观过，当年还能够上甲板、进驾驶舱游览，舰体不远处还有“中山舰抗日阵亡将士纪念碑”。

来到博物馆一楼“舰体复原陈列区”，入口附近陈列有几组百年前的军舰“船模”，此外还陈列有美国1943年生产的军用吉普车——威利斯MB型越野汽车。

复原后的中山舰陈列在高大宽阔的舰体馆里，舰体外侧也是临展区，是《为民族复兴而奋斗——孙中山与中国共产党人》的主题展。

主题展览包括四个部分：（一）救亡图存：辛亥革命与早期中国共产主义者。重点展示孙中山领导的辛亥革命，早期共产主义者与辛亥革命的关系。（二）艰辛探索：新道路的选择与新的希望。重点展示孙中山对革命道路的新探索，中国共产党的诞生给孙中山带来的新希望，揭示第一次国共合作的历史必然性。

主题展览（三）是“真诚合作”：开创革命新局面， 重点展示国共合作的经过及影响。（四）是“走向复兴”：中国共产党人对孙中山事业的继承和发展。重点展示中国共产党人在孙中山逝世后如何继承他的遗志，体现共产党人为民族复兴的历史担当。

    展览还有“特别篇”——孙中山与中山舰、武汉。用大量的文史资料展示了孙中山广州蒙难、中山舰事件和武汉抗战等重大历史事件。