穿过接引殿，殿宇东北角有块古碑，碑面模糊不清，包裹得严严实实。这是明代遗存，驮碑的赑屃是绿色，比较少见。

接引殿之后有几组石阶可到大雄宝殿，西面是迦蓝殿和僧舍；东面是斋堂和僧舍，红瓦黄墙，简洁朴素。

宝通禅寺建于魏晋时期，原名做东山寺，唐贞观年间改名为弥陀寺，随后南宋端平年间改名为崇宁万寿禅寺。寺院屡毁屡建，公元1485年，明宪宗将重建后的寺庙更名为宝通禅寺，后遭到毁坏，清康熙年间又进行了重修，最近一次重建是上世纪八十年代。

大雄宝殿雄伟肃穆，殿前置有“法入间法”、“ 名甲海内”和“秀出千峰”三匾。宝殿供奉有三位主尊，佛教缔造者释迦牟尼居中，身后左右为文殊、普贤两菩萨，两厢有十八罗汉。

穿过大雄宝殿，后殿挂有“慈航普渡”匾额，供奉着南海观音菩萨。

大雄宝殿与藏经楼之间是个广场，西面是客堂，东面是斋堂。

藏经楼下是玉佛殿，玉佛殿东端是大澈堂；西端是方丈室与道根老和尚纪念堂。