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支原体DNA提取的准备工作与操作步骤及注意事项!

(2026-01-13 15:09:49)
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知识

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注意事项

分类: 微生物菌种

     支原体DNA提取的准备工作与操作步骤及注意事项!

 

 

百欧博伟生物:以下是支原体DNA提取的常规操作步骤(以实验室常用方法为例):

 

一、实验前准备

 

1、材料与试剂:

 

支原体培养物(如SP4培养基培养的支原体菌液)。

 

裂解缓冲液(含SDS、蛋白酶K、EDTA等)。

 

-氯仿-异戊醇(25:24:1)。

 

无水乙醇或异丙醇(用于DNA沉淀)。

 

TE缓冲液(pH 8.0)或无菌去离子水(溶解DNA)。

 

RNase A(可选,用于去除RNA)。

 

PBS缓冲液(用于洗涤菌体)。

 

2、仪器与耗材:

 

离心机、水浴锅/金属浴、微量移液器、离心管、无菌枪头等。

 

二、操作步骤

 

1、样本处理

 

支原体培养物:

 

1-5 mL支原体培养液,12,000 ×g 离心10分钟(4),弃上清。

 

1 mL PBS重悬菌体沉淀,再次离心,重复洗涤1-2次以去除培养基杂质。

 

临床样本(如细胞培养上清):

 

若样本中支原体浓度低,需先通过0.22 μm滤膜过滤去除宿主细胞,再超速离心(如15,000 ×g,30分钟)浓缩菌体。

 

2、细胞裂解

 

向菌体沉淀中加入200 μL裂解缓冲液(含1% SDS和20 mg/mL蛋白酶K),涡旋混匀。

 

55水浴孵育1小时(或金属浴),每隔15分钟轻柔颠倒混匀。

 

(可选)加入1-2 μL RNase A(终浓度100 μg/mL),37孵育30分钟去除RNA。

 

3、DNA纯化

 

方法一:酚-氯仿抽提法

 

向裂解液中加入等体积酚-氯仿-异戊醇(约200 μL),涡旋混匀10秒。

 

12,000 ×g 离心10分钟(室温),小心吸取上层水相至新离心管。

 

重复酚-氯仿抽提1次。

 

加入等体积氯仿(去除残留酚),离心后取上层水相。

 

方法二:试剂盒法

 

(如使用商品化DNA提取试剂盒,按说明书操作)

 

将裂解液转移至吸附柱,离心后弃废液。

 

用漂洗液洗涤吸附柱2次,离心去除残留乙醇。

 

将吸附柱置于新离心管中,加入50-100 μL TE缓冲液或无菌水,静置1分钟后离心洗脱DNA。

 

4、DNA沉淀与溶解

 

向纯化后的水相中加入1/10体积3 M醋酸钠(pH 5.2)和2.5倍体积预冷无水乙醇(或等体积异丙醇),轻柔混匀。

 

-20静置30分钟至过夜,或干冰速冻5分钟。

 

12,000 ×g 离心15分钟(4),弃上清。

 

70%乙醇洗涤沉淀2次,离心后倒置晾干(避免过度干燥)。

 

加入50-100 μL TE缓冲液或无菌水溶解DNA,55水浴10分钟促进溶解。

 

三、DNA质量检测

 

浓度与纯度:使用测定A260/A280比值(理想值1.8-2.0)。

 

完整性:琼脂糖凝胶电泳(1%胶),观察是否有清晰条带(支原体基因组DNA通常为弥散条带)。

 

四、注意事项

 

避免污染:实验全程使用无菌耗材,操作台用紫外灭菌;更换枪头避免交叉污染。

 

轻柔操作:支原体无细胞壁,裂解时避免剧烈涡旋,防止DNA断裂。

 

临床样本处理:若检测细胞培养物中的支原体污染,需先去除宿主细胞DNA。

 

储存:DNA短期保存于4,长期保存于-20或-80。

 

五、常见问题

 

DNA得率低:可能因裂解不彻底,可延长蛋白酶K消化时间或增加起始样本量。

 

RNA残留:增加RNase A处理步骤。

 

蛋白质污染:重复酚-氯仿抽提或优化漂洗步骤。

 

根据实验需求选择适合的纯化方法(传统抽提法成本低但步骤繁琐;试剂盒法快速但成本较高)。

 

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