研究发现食物微生物群占成人肠道微生物群的约3%！

百欧博伟生物：食物决定了我们的健康，而我们摄入的每一种食物都带有它们自己的微生物群。这一点非常有趣，尤其是考虑到这些食物微生物群可能比我们肠道内的微生物群更为神秘。因此，一个重要的问题浮现：食物中的微生物群究竟在多大程度上影响了我们的肠道微生物群？

为了回答这个问题，研究人员通过测序2533种不同食物的宏基因组，开发了一个食物微生物群数据库。他们鉴定出了10,899种与食物相关的微生物，其中一半是此前未知的物种，并且发现这些微生物平均占成年人肠道微生物群的3%，而在婴儿中则高达56%。

这项研究的详细结果发表在《细胞》期刊上，题为《来自2500种食物宏基因组的未探索微生物多样性及其与人类微生物群的联系》。研究的联合资深作者、特伦托大学和米兰欧洲肿瘤研究所的计算微生物学家Nicola Segata博士表示：“这是目前为止对食物中微生物的最大规模调查。我们现在可以利用这一参考数据，更好地理解食物的质量、保存、安全性以及其他特性与其中的微生物之间的联系。”

传统上，食物中的微生物通常通过在实验室中逐一培养来进行研究，但这一过程耗时且效率低下，且并非所有微生物都易于培养。为了更全面和高效地表征食物微生物群，研究人员利用了宏基因组学这一分子工具，能够同时测序每种食物样本中的所有遗传物质。虽然宏基因组学通常用于分析人类微生物群或环境样本，但此前并未在如此大规模上用于研究食物。

“食品微生物学家已经研究食物并进行食品安全检测已有一百多年，但我们对现代DNA测序技术的利用还不够充分，”联合资深作者、Teagasc、APC微生物群爱尔兰和VistaMilk爱尔兰的微生物学家Paul Cotter博士指出。“这是该领域研究的新起点，我们将充分利用现有的分子技术。”

研究团队分析了来自50个国家的2533个食物相关的宏基因组，其中包括1950个新测序的宏基因组。这些宏基因组来自多种食物，其中65%为乳制品，17%为发酵饮料，5%为发酵肉类。

这些宏基因组包含了10,899种与食物相关的微生物，这些微生物被分类为1036种细菌和108种真菌物种。类似的食物往往含有相似类型的微生物——例如，不同发酵饮料中的微生物群落彼此相似，但与发酵肉类中的微生物差异较大——不过乳制品之间的差异更大，这可能是由于调查的乳制品种类更多。

尽管研究人员在食物样本中并未发现许多明显的致病细菌，但他们确实鉴定出了一些可能对食物风味或保存产生不利影响的微生物。了解不同类型食物中应有的微生物群，能够帮助生产者——无论是工业生产者还是小规模生产者——生产出更一致且更受欢迎的产品。此外，这也可以帮助食品监管部门明确哪些微生物应存在于特定类型的食物中，以及哪些不应存在，以验证“本地”食品的身份和来源。

Segata表示：“我们发现一些微生物存在于不同的食物中，执行着相似的功能，同时我们也发现每个本地设施或农场的食物具有独特的特征。这一点很重要，因为它可以进一步提升本地食品的特异性和质量的概念，我们甚至可以利用宏基因组学来验证来自特定设施或地区的食品的真实性。”

了解食物微生物群对人类健康也可能有重要影响，因为我们摄入的一些微生物可能会成为我们自身微生物群的稳定成员。为探讨食物相关微生物与人类微生物群的重叠，研究团队将他们的新数据库与19,833个此前测序的人类宏基因组进行了比较。结果表明，食物相关的微生物种类构成人类成年肠道微生物群的约3%，而在新生儿中则超过50%。

Segata指出：“这表明我们的一些肠道微生物可能直接来自食物，或者在人类历史上，某些微生物是从食物中获得的，然后这些微生物逐渐适应，成为人类微生物群的一部分。尽管3%的比例看似很小，但在我们体内这些微生物的功能可能非常重要。通过这个数据库，我们可以大规模地调查食物微生物的特性如何影响我们的健康。”

这项研究是MASTER EU联盟的主要成果之一，MASTER EU是一个涵盖14个国家29个合作伙伴的欧盟资助计划，旨在表征整个食品链中微生物的存在及其功能。

Cotter表示：“未来，我们希望探索这些食物微生物群在不同食物、文化、生活方式和人口中的多样性。”

微生物菌种查询网隶属于北京百欧博伟生物技术有限公司，成立于二〇一四年十月份，是一家专业提供中国微生物菌种，标准菌种，质控菌株,ATCC菌种,细胞系以及培养基等产品的查询网站！自成立至今，已提供各类微生物菌种、细胞、培养基数量达四万余份，接待咨询客户数量5万余人次，成交合同数量2万余份！是国内微生物菌种及细胞信息Z全的网站！ 我们拥有自主研发能力，提供的ATCC菌种达15000余份,ATCC各类细胞系达3000余份,保藏中心涵盖菌种资源更达数十万余份！