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环状RNA(circular
RNA,circRNA)是最近发现的一类特殊的非编码RNA,它大量存在于真核细胞胞质内,主要由pre-mRNA通过可变剪切加工产生。近年研究发现,circRNA具有很多重要的调控功能,例如,circRNA可以作为竞争性内源RNA(competing
endogenous
RNA,ceRNA)结合胞内miRNA,阻断miRNA对其靶基因的抑制作用。除此以外,circRNA也具有调控其他类型RNA、调节蛋白质活性等功能。circRNA在不同物种中具有保守性,而且存在组织表达差异,且circRNA的环状结构对RNase不敏感,导致它比线性RNA更为稳定,这些特性使得circRNA具有开发疾病新型诊断与治疗方法的巨大潜力,研究意义重大。
特点:
存在范围广泛,在真核生物体、病毒、类病毒以及古生菌中均发现存在circRNA,在真核生物体中,大部分circRNA
存在于胞浆中,易跨膜,少数存在于细胞核内;
具有高表达性以及组织特异性,在不同的组织中,circRNA 的表达情况不同,且具有生长阶段表达差异性;
相对于线性结构,circRNA 不含有poly A尾巴,不易被核酸外切酶裂解,在生物体中更加稳定地存在;
外显子来源的circRNA 具有与对应的线性RNA 相同的转录序列,但不翻译成蛋白,为非编码RNA;
具有高度物种保守性;
一些circRNA 能结合miRNA,并与miRNA 相互作用,同时在转录水平或转录后水平发挥着重要的调控作用.
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服务内容:
1)环状RNA生物信息学预测
2) 环状RNA高通量测序
3)环状RNA表达丰度检测
4)FISH
检测环状RNA的亚细胞定位
5)NorthernBlot
检测环化RNA的存在
6)环状RNA的过表达实验(Gain
of function)
7)环状RNA功能缺失实验(Loss
of function )
8)环状RNA与miRNA互作结合生物预测及实验验证
9)环状RNA与miRNA相互作用预测研究
10)环状RNA与蛋白相互作用研究
重要意义:
在对circRNA
结构和功能研究的基础上,有研究人员发现它们在动脉粥样硬化,神经系统紊乱,糖尿病和肿瘤等疾病发生过程中,发挥非常重要的作用。对环状RNA研究具有重要的意义:
1)circRNA独具的竞争性内源(ceRNA)特征可为药物开发提供新的思路;
2)circRNA的组织特异性和稳定性有可能使circRNA成为一种良好的生物标志物;
3)circRNA
的研究为生命的进化研究提供新的方向。
cricRNA功能相关其它服务内容详细:
1. circRNA
RIP(RNA 免疫共沉淀)实验
2. circRNA
荧光原位杂交 FISH 检测
3. circRNA
Luciferase报告基因系统检测
4. circRNA
qPCR芯片检测
5. circRNA
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