周恩来代表党中央和中央军委作关于目前战略方针问题的报告，着重阐明战略方针、行动方针和战略指挥三个问题，强调两个方面军要统一指挥，集中于中央军委。张闻天作会议总结。会议一致通过周恩来报告中提出的建立川陕甘根据地的战略方针，并责成张闻天起草一个中央政治局决定。6月28日，中央政治局作出《关于一、四方面军会合后战略方针的决定》。两河口会议确定了新的战略方针，为两个方面军共同北上，进一步扩大苏维埃运动指明了方向。