咽部肿瘤

如发生在舌根部或扁桃体的肿瘤，早期症状与慢性单纯性咽炎相似，一般通过咽部检查即可排除。

茎突综合征

即茎突发育过长或者方位及形态异常引起的咽部疼痛及不适感，与慢性单纯性咽炎症状不易区分。改变一般多为单侧发病，通过X线、CT检查可鉴别。

早期食道癌

多表现为咽部不适及胸骨后压迫感，后期会出现吞咽困难。必要时需进行食道镜或食道CT以排除。

结核病

如肺结核、咽结核等，也可出现咽部不适感，需进行结合相关检查以明确诊断。