SYBRGreenI荧光染料法解析
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分类: 分子生物学 |
SYBR Green I方法是目前最为常见的荧光染料,其作用原理为:SYBR Green I是一种只与双链DNA小沟结合的染料,并不与单链DNA链结合,而且在游离状态不发出荧光,只有掺入DNA双链中才可以发光,因此,在PCR体系中,随着特异性PCR产物的指数扩增,每个循环的延伸阶段,染料掺入双链DNA中,其荧光信号强度与PCR产物的数量呈正相关(见图1-1)。基于SYBR Green I染料法的荧光定量PCR的最大优点是通用性强,适用于所有的荧光定量PCR反应,同时,其缺点也在于其非特异性。当PCR反应中有引物二聚体或者非特异性扩增时,该染料也可以和这些非特异性扩增产物结合,发出荧光,从而干扰对特异性产物的准确定量。但是通过对PCR产物的熔解曲线进行分析,使非特异性扩增的问题得以解决,从而保证荧光信号的特异性。Tm值得概念:Tm为DNA解链一半时的温度,不同的双链DNA由于其碱基组成不同,长度不同,因此Tm值也不同,据此可以判断是否获得同一PCR产物(见图1-2),当非特异峰Tm>特异峰Tm时,一般为非特异扩增,当非特异峰Tm<特异峰Tm,或者在72左右时,一般为引物二聚体,当然最后要依据琼脂糖电泳的结果进行验证。
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